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420 次 WGBS揭示AtSAMS通過DNA甲基化植物花器官發(fā)育的表觀遺傳機制 2025-3-27
花器官是植物繁殖的關鍵結構，其發(fā)育受到嚴格的遺傳調控。ABC模型是解釋花器官發(fā)育的經(jīng)典理論，其中A、B、C、E功能基因分別調控萼片、花瓣、雄蕊和雌蕊的形成。然而，這些基因的表達調控機制尚未
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437 次 Cell文獻：轉座子外顯化構成了一個受進化選擇的功能蛋白質亞型儲庫 2025-3-24
轉座子（Transposable Elements，TEs），又稱轉座元件，指在基因組中能夠移動或復制，并可以整合到基因組新位點的一段DNA序列。可變剪接（Alternative Splicing，AS），又稱選擇性剪接，是指從一
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382 次 cfWGBS揭示與年齡和肌萎縮側索硬化相關cfDNA甲基化變化及組織 2025-2-27
游離細胞DNA (Cell-free DNA，cfDNA)是血漿中游離的DNA片段，通常來源于正常細胞更新或病理狀態(tài)下的細胞死亡。cfDNA已被廣泛應用于癌癥早期檢測、胎兒遺傳病診斷、器官移植評估等領域。然而，cf
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427 次 時空組學研究進展（二)：單細胞RNA測序數(shù)據(jù)的分析方法 2025-1-8
期刊：Science China-Life Sciences影響因子：8.0scRNA-seq 的原始數(shù)據(jù)格式和目前大多數(shù)scRNA-seq 分析過程都基于 FASTQ 文件（或壓縮格式 fq.gz）。Illumina 平臺測序數(shù)據(jù)默認生成 BCL 格式文件
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723 次 時空組學研究進展（一）：單細胞RNA測序的流程與技術 2025-1-8
期刊：Science China-Life Sciences影響因子：8.0單細胞測序概述單細胞測序（Single-cell RNA sequencing; scRNA-seq）是一種開創(chuàng)性的單細胞測序技術，現(xiàn)在已得到廣泛普及，并涵蓋了多種方法。盡
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919 次 DAP-seq助力揭示番茄抗酸鋁分子調控新機制 2024-10-23
2024年10月2日，云南農(nóng)業(yè)大學園林園藝學院營養(yǎng)逆境與品質改良楊建立/范偉團隊在Horticulture Research期刊(IF=7.6)上在線發(fā)表題為“SlSTOP1-regulated SlHAK5 expression confers Al toler
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829 次 Sfrp1抑制肺成纖維細胞向損傷誘導的肌成纖維細胞轉變期間的侵襲 2024-10-15
期刊：European Respiratory Journal影響因子：16.6主要技術：scRNA-seq；空間轉錄組；成纖維細胞導語組織纖維化是大多數(shù)主要慢性疾病中最大的未解決的臨床問題之一，產(chǎn)生細胞外基質（ECM）的肌
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867 次 植物組學時代的DNA甲基化研究在群體表觀遺傳學中的應用 2024-8-20
DNA甲基化在許多生物過程中發(fā)揮著重要作用。得益于數(shù)十年來對DNA甲基化突變體的研究，如今對DNA甲基化的建立和維持機制有了很好的理解，尤其在擬南芥（Arabidopsis thaliana）的Col-0品系中的研
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946 次 空間轉錄組學在揭示獨特和保守的腫瘤核心和邊緣結構中的應用 2024-6-12
期刊：Nature Communications影響因子：16.6主要技術：ScRNA-seq、ST導語腫瘤微環(huán)境的空間組織對生物學和治療反應有著深遠的影響。對hpv陰性口腔鱗狀細胞癌(OSCC)進行了單細胞和空間轉錄組學分析
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915 次 DAP-seq與RNA-seq聯(lián)合分析助力揭示AvERF73參與調控獼猴桃的耐澇性 2024-4-24
澇害（Waterlogging）是長期陰雨或暴雨后，由于地表積水，地面徑流不能及時排除，積水深度過大，時間過長，造成作物根部氧氣不足，并產(chǎn)生乙醇等有毒有害物質，從而影響作物生長，甚至造成作物死
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760 次 RNA-seq技術探究從牛膝中分離得到的果膠多糖被人體腸道擬桿菌代謝 2023-9-25
期刊：Int J Biol Macromol影響因子：8.2伯豪技術服務：RNA-seq導語牛膝是治療骨質疏松癥的著名中藥。多糖是形成腸道微生物群的主要因素，是雙棱草的主要成分。然而，雙歧桿菌多糖對人體腸道菌群
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807 次 scRNA-seq在彌漫性大B細胞淋巴瘤的單細胞轉錄組圖譜繪制中的應用 2023-8-2
期刊：Cell Reports影響因子：8.8導語彌漫性大B細胞淋巴瘤（DLBCL）是最常見但侵襲性最強的B細胞淋巴瘤之一，大約40%的患者仍然無法治愈。本研究使用單細胞測序（scRNA-seq）技術成功繪制了彌漫
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987 次 RNA-seq等技術應用與探究結直腸癌遠端轉移起源于殘留的EMP1+細胞 2023-6-16
期刊：Nature影響因子：69.504導語大約30-40%的接受了原發(fā)性腫瘤根治性切除術的結直腸癌（colorectal cancer CRC）患者將在幾年后發(fā)生轉移。重要臟器的轉移及術后復發(fā)仍是主要的致死原因。然而，
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814 次 全基因組DNA甲基化和小RNA分析揭示甘藍型油菜種子的基因組不對稱性 2023-6-9
多倍體是被子植物基因組進化中的一種持續(xù)現(xiàn)象，有助于現(xiàn)存開花植物的多樣性。甘藍型油菜（Brassica napus）是世界上最重要的被子植物油料作物品種之一，起源于Brassica rapa（An）和Brassica ol
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618 次 小檗堿通過介導m6A mRNA甲基化調控斑馬魚肝細胞氧化應激 2023-6-6
中藥小檗堿（Berberine，BBR，化學式C20H18NO4）是從幾種藥用植物中分離出的一種異喹啉季生物堿，包括小檗（Berberis aristata）和黃連（Coptis chinensis）。小檗堿可改善脂質代謝紊亂誘導的細
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1034 次 全基因組ChIP-seq分析揭示細菌轉錄因子PhoB的基因內結合位點 2023-5-30
細菌編碼許多轉錄因子（transcription factor，TF），這些轉錄因子通過與啟動子周圍的DNA結合并調控RNA聚合酶（RNAP）全酶以結合啟動子DNA或異構化為主動轉錄構象的能力來調節(jié)轉錄起始。目前對T
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814 次 MeRIP-seq等揭示m6A reader YTHDF1在結直腸癌PD-1免疫治療中的作用 2023-5-26
大家好，這里是專注表觀組學十余年，領跑多組學科研服務的易基因。結直腸癌（colorectal cancer ，CRC）是全球最常見的癌癥之一，轉移性CRC患者的5年生存率低于20%。免疫檢查點阻斷（Immune che
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906 次 mRNA-seq轉錄組測序應用于原位自組裝類器官用于軟骨組織再生 2023-5-24
期刊：Bioact Mater影響因子：14.593導語由于在誘導間充質干細胞(MSCs)向軟骨和骨室的空間、定向和可控分化方面存在困難，分級骨軟骨單位的再生具有挑戰(zhàn)性。新興的類器官技術為骨軟骨再生提供了
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705 次 全基因組DNA甲基化分析揭示DNMT1在斑馬魚模型聽覺系統(tǒng)發(fā)育中的作用 2023-5-23
聽力障礙通常與內耳發(fā)育不全或損傷有關，是影響生活質量的嚴重健康問題。因此研究聽覺器官發(fā)生過程中的關鍵基因對于探索聽力損傷的潛在策略至關重要。斑馬魚模型在理解內耳發(fā)育不良和相關疾病的
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1047 次 DNA甲基化和轉錄組分析揭示野生草莓干旱脅迫分子調控機制 2023-5-12
干旱脅迫是對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)產(chǎn)生不利影響的關鍵環(huán)境因素。為此，植物發(fā)展出各種響應機制（干旱逃逸、避免、耐受和回復），以通過進化增強抗旱性，這些適應機制從分子到植物水平都所不同。黃毛草莓（Fr
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