基因組研究
宏病毒組研究
近期,諾禾致源與一線疾控中心通力協作,針對確診病例和疑似病例的不同組織(咽喉、血液、肺泡灌洗液)進行宏病毒組的研究。該項目通過 Illumina nova6000 的測序平臺,測序數據量一般推薦10G,將 rRNA 去除后構建轉錄組文庫。研究中我們發揮出諾禾致源在基因檢測的技術和研究的最大優勢,助力疫情防控。
宏病毒的研究,是以環境中 RNA 病毒的核酸為研究對象,能夠快速準確的鑒定出環境中所有的病毒組成,在病毒發現、病毒溯源、微生物預警等研究方面具有重要作用。已知 SARS-CoV-2(新冠病毒)是屬于套式病毒目、冠狀病毒科、冠狀病毒屬,是一類具有囊膜、基因組為線性單股正鏈的 RNA 病毒。在2020年2月14日世衛組織公布的關于新冠病毒的針對性研究方向中,首先被提出的就是為更好地理解新冠病毒的自然史、傳播模式和診斷方法,研究人員將專注于病理模型開發,包括感染、疾病和傳播的動物模型,并開發用于監測和研究病毒表型改變和潛在適應性的工具,并支持通過應用診斷工具及相關產品來改善臨床過程。針對這個研究重點,高通量二代測序的宏病毒組學,能夠大樣本量,大數據量的提供不同病毒的序列信息,在樣本中的表達情況,進化方向,突變現象等一系列可以指導生物學研究及臨床應用的有效數據證據。目前,針對 SARS-CoV-2 的合作項目,RNA 研究部專門組織了項目運行小組,指定負責人專項對接和推進研究。已有多個科研合作項目接入,待客戶建庫后即可進行后續的合作服務。
在這次抗擊戰中,我們的優勢
1. 短周期,高通量,全分析。采用先進的測序平臺,高通量覆蓋可全面檢測生態環境中的微生物信息,充分挖掘樣品中存在的微生物多樣性及動態變化情況。
2. 諾禾致源是商業科研領域為數不多的可以進行宏病毒轉錄組測序分析的公司,宏病毒轉錄組不僅進行基因表達情況以及差異基因表達分析,還進行物種注釋及分類分析,多樣品間的比較分析,病毒進化分析等。此外,針對宏病毒的測序結果,諾禾致源還可以提供個性化分析的服務,可以根據不同需求定制分析內容。
3. 宏病毒轉錄組采用先進的 Illumina 測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用 DELL 計算節點和 Isilon 存儲的高效組合,實現快速穩定的測序數據分析及交付。
諾禾致源丨提供領先的基因科技解決方案
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