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BIA超螺旋質(zhì)粒純化pDNA大規(guī)模層析純化柱
英文名稱:總訪問:571
國產(chǎn)/進口:進口半年訪問:90
產(chǎn)地/品牌:BIA Separations產(chǎn)品類別:液相色譜
型       號:311.5114-2 最后更新:2021-11-25
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【上海精瑞科學儀器有限公司 BIA Separations 中國區(qū)代理】一家專業(yè)提供HPLC色譜柱、GC色譜柱、SPE前處理小柱和其他實驗室常用耗材、配件的公司,同時提供各種進口標準品和各類分析儀器
歡迎咨詢:
15901762218 馮女士(微信同號)
QQ:3295336257

BIA Separations整體色譜柱*的開發(fā)商和制造商,為生產(chǎn)、純化、和分析生物大分子提供新的解決方案,是*能提供滿足生物、醫(yī)藥行業(yè)研究和生產(chǎn)需要的生物大分子整體色譜柱的歐洲公司,公司致力于成為創(chuàng)新的生物色譜領(lǐng)域的 。

 

BIA公司總部在斯洛文尼亞,設(shè)有研發(fā)、生產(chǎn)和銷售部門,在美國和亞洲設(shè)有銷售辦事處。

 

BIA公司開發(fā)和生產(chǎn)*質(zhì)量的整體柱, 并提供*的研究和生物分子的純化和分析方法開發(fā)服務。

 

上海精瑞科學儀器有限公司成為BIA Separations中國區(qū)合作伙伴,將幫助BIA全線產(chǎn)品和技術(shù)在中國推廣,為用戶提供完備的售前及售后技術(shù)服務。

 

  • 2012年成為 SDK Corporation (Shodex)公司的戰(zhàn)略合作伙伴(該公司市值達90億美元,總部設(shè)在日本)

  • 已經(jīng)通過FDA認證(根據(jù)美國GMP規(guī)定),JAZMP認證(根據(jù)歐盟GMP規(guī)定),ISO 9001: 2008 等認證

 

一、monolith整體柱

BIA Separations公司的monolith整體柱,是在柱管內(nèi)原味聚合成具有多孔結(jié)構(gòu)的連續(xù)整體高聚物材料,因此與傳統(tǒng)裝填柱相比,

  • 整體柱具有滲透性好、柱前壓低、活性位點利用率高,峰容量高等優(yōu)點;

  • 整體柱中既有流動相的流通孔又有便于溶質(zhì)進行傳質(zhì)的中孔(幾十個納米)

  • 因而可以對生物大分子進行快速分離 (生物大分子特性在傳統(tǒng)色譜柱中不能完全接近固定相表面)。

 

二、CIMmultus™制備柱

BIA的 CIMmultus™制備柱是一種新型改進的預包裝色譜整體柱,其特點是:

  • 大流量通道,可用于處理大蛋白(IgG,IgM,PEG化蛋白),(AAV,腺,慢,,噬菌體) ,VLPs和pDNA;

  • CIMmultus™色譜柱符合cGMP標準。


   該方法專為純化大分子和納米顆粒的整體柱而設(shè)計,可實現(xiàn)快速操作,高流量,同時提供動態(tài)結(jié)合能力和分辨率。



 

首先要為整個過程中的核心——兩步層析步驟,準備細菌培養(yǎng)液
 

1. 大腸桿菌收獲、裂解-堿裂解:
 

這是快速高效純化質(zhì)粒 DNA 亞型的基礎(chǔ)。
 

操作建議:
 

  先收集菌體;
  然后采用堿性裂解法制備原料;

  再將細菌細胞(通常是細胞生物質(zhì)或細胞沉淀)懸浮在 50 mMTris-HCl,10 mM EDTA,pH8.0 中;

  通過加入等體積的 0.1-0.4M NaOH,1%SDS 進行裂解。
 

2. 裂解液濃縮:
 

氯化鈣沉淀后澄清,除去了大量的主要樣品雜質(zhì)

​​​​​​​   裂解后,懸浮液變粘稠,通過加入與懸浮緩沖液等體積的,4-8℃ 冷卻的 3M CH 3 COOK(pH 5.5)沉淀細胞碎片和 SDS 復合物。

​​​​​​​   在溫和混合下,緩慢加入 CaCl2 并孵育 15 分鐘。
 

TIPS:
 

1. 氯化鈣用作沉淀劑,以去除 RNA、基因組 DNA 和其他雜質(zhì);

2. 較高濃度的雜質(zhì)需要 CaCl2 濃度高達 1M;

3. 考慮測試多種濃度并評估產(chǎn)品中雜質(zhì)的有效去除和未受影響的 pDNA 產(chǎn)量;

4. 加入速度應該很慢,以防止局部溫度上升;

5. 孵育后,進行一系列澄清步驟,從離心或粗過濾開始,例如 80μm 深度過濾,并以 1-5μm 過濾結(jié)束。

(低溫有利于沉淀,混合過程應該溫和操作,以防止 DNA 降解。)

 


 

前面 blabla 說了那么多,然而純化才是本工藝的精華所在。
 

BIA Separations 的二步純化工藝的穩(wěn)健性、連貫性、時效性,均堪稱教科書式的經(jīng)典。
 

第一步純化的柱子,通過弱陰離子交換,濃縮 pDNA 并去除大部分 HCP、mRNA 和基因組 DNA;
 

第二步利用疏水相互作用色譜(HIC)的拋光步驟,進一步從超螺旋(SC)治療級 pDNA 中除去開環(huán)(OC)和線性 pDNA 亞型。
 

兩步純化的作用功能明確、互相合作,大大節(jié)省操作步驟和時間。



 

​​​​​​​   AEX 色譜柱(CIMmultus™DEAE)濃縮 pDNA,并去除大部分 HCP、mRNA 和基因組 DNA。

​​​​​​​   在弱陰離子交換柱上捕獲質(zhì)粒 DNA,其中除去剩余的 RNA 和蛋白質(zhì),樣品結(jié)合需要低電導率,通過稀釋實現(xiàn)。 

​​​​​​​   隨著增加 NaCl 的梯度洗脫,首先洗脫 RNA,然后洗脫質(zhì)粒 DNA。

 

層析條件
 

Monolithic column:

CIMmultus™  DEAE(2 µm)*1

Mobile phase:

Equilibration  buffer A1: 50 mM Tris, 10 mM EDTA,   pH 7.2

 

Washing buffer  A2: 50 mM Tris, 10 mM EDTA, 0.6 M   NaCl, pH 7.2

 

Elution buffer  A3: 50 mM Tris, 10 mM EDTA, 1 M   NaCl, pH 7.2

Working flow rates:

0.5 – 5 column volume (CV) /min (具體取決于樣品特性,使用的層析設(shè)備和色譜柱尺寸)

*1 選擇色譜柱體積,取決于需要處理的樣品量。
 

層析方法
 

1.  用去離子水稀釋細菌裂解物至電導率為 35-40mS / cm。稀釋取決于樣品制備過程中添加的 CaCl2 濃度。

2.  將稀釋的樣品用 0.45μm 過濾器進行過濾。

3.  將 20CV 的緩沖液 A1 平衡 DEAE 柱。

4.  將澄清的稀釋細菌裂解液進行上樣。

5.  用 20 CV 的緩沖液 A1 對色譜柱進行流洗。

6.  用 20 CV 的緩沖液 A2 對色譜柱進行流洗。

7.  用 20 CV 的緩沖液 A3(以半工作流速)洗脫并收集 pDNA。


圖 1:AEX CIMmultus™DEAE(2μm)柱上的質(zhì)粒 DNA 洗脫曲線



 

​​​​​​​    在高配體密度丁基修飾的(CIMmultus TM C4 HLD)整體柱上,利用疏水相互作用色譜柱(HIC)的拋光步驟,進一步從        超螺旋(SC)治療級 pDNA 中除去開環(huán)(OC)和線性 pDNA 亞型。

​​​​​​​ ​​​​​​​   為了富集質(zhì)粒 DNA 的超螺旋亞型,將 DEAE 洗脫液上樣到高配體密度丁基柱(C4 HLD)上。 

​​​​​​​ ​​​​​​​   該步驟進一步去除了雜質(zhì)。

 

層析條件

 

Monolithic  column:

CIMmultus™ C4  HLD (2 µm)*2

Mobile phase:

Equilibration  buffer B0:   50 mM Tris, 10 mM EDTA, 3 M   (NH4)2SO4, pH 7.2

 

Washing  buffer  B1: 50 mM Tris, 10 mM EDTA, 1.7  M (NH4)2SO4, pH 7.2

 

Adjustment  buffer: 4 M (NH4)2SO4

 

Elution  buffer  B2: 50 mM Tris, 10 mM EDTA, 0.4  M (NH4)2SO4 , pH 7.2

 

Regeneration  buffer A1: 50 mM Tris, 10 mM EDTA, pH 7.2

Working flow  rates:

0.5 – 5 CV/min (具體取決于樣品特性、使用的層析設(shè)備和色譜柱尺寸)

*2 選擇色譜柱體積,取決于需要處理的樣品量。
 

層析方法

 

1.  調(diào)節(jié)來自 DEAE 柱的含 pDNA 洗脫液,每 1 體積(V)洗脫液加入 3 體積(V)的 4M(NH4)2SO4。

2.  用 20CV 的緩沖液 B0 來平衡 C4 HLD 柱。

3.  將 DEAE 柱洗脫的 pDNA 組份上樣。

4.  用 20 CV 的緩沖液 B1 流洗色譜柱。

5.  用緩沖液 B2(以半工作流速)洗脫并收集 pDNA。

6.  用 30 CV 的緩沖液 A1 再生色譜柱。

7.  加樣 3 次后,對柱子進行清洗。


圖 2:在 HIC CIMmultus TM C4 HLD(2μm)柱上分離超螺旋質(zhì)粒 DNA



 

·  從 C4 HLD 柱洗脫的超螺旋 pDNA 組份含有硫酸銨,必須在生物應用質(zhì)粒之前將其除去。

·  緩沖液交換可通過透析濾過或體積排除色譜等方法進行。

·  配置和填充可能需要額外的處理。
 

二步法層析過程分析:

 

​​​​​​​    質(zhì)粒 DNA 制造成功的關(guān)鍵是實時過程控制方法,確保最終產(chǎn)品中高百分比的超螺旋 pDNA。 

​​​​​​​​​​   CIMac™pDNA 分析柱可用于監(jiān)測降解產(chǎn)物(開環(huán)和線性 pDNA),去除雜質(zhì)(RNA),并確保每個生產(chǎn)步驟都能產(chǎn)生預期的超螺旋 pDNA 量。

​​​​​​​   ​​​​​​​CIMac™pDNA 分析柱還用于超螺旋質(zhì)粒 DNA 含量的質(zhì)量控制。


圖 3:使用 CIMac™pDNA-0.3 分析柱的質(zhì)粒 DNA 亞型含量的質(zhì)量控制

 

結(jié)果和結(jié)論:
 

​​​​​​​ ​​​​​  通過優(yōu)化裂解、沉淀和兩種色譜步驟相結(jié)合,可生產(chǎn)滿足所有監(jiān)管要求的純 pDNA。

​​​​​​​ ​​​​​​​  可以完成去除 99% 以上的主要雜質(zhì)(RNA,基因組 DNA,宿主細胞蛋白,內(nèi)毒素和開環(huán) pDNA)。

​​​​​​​ ​​​​​​​  此外,快速(大腸桿菌的 pDNA 提取和純化可在幾小時內(nèi)完成),可重復的過程可降低運營成本并提高工廠生產(chǎn)率。 

​​​​​​​ ​​​​​​​  獨特的整體特性有助于該過程的直接可擴展性,涵蓋從小規(guī)模實驗室到大規(guī)模工業(yè)純化 pDNA 的生產(chǎn)水平。


Table 1: Process results.

Process  yield

>  80 %

A260/280

1.92

Homogeneity  (SC pDNA)

>  97 %

HCD  – removed

>  99.5 %

HCP  - removed

>  99 %

Endotoxin

<  2 EU/mg pDNA

RNA  - removed

>  99 %

 

點評 
 

目前市面上有不少質(zhì)粒純化工藝方案,但是比較下來,BIA 二步法純化工藝具有兩大優(yōu)勢:
 

​​​​​​​  效率明顯提高

只需兩步色譜和高流速的整體柱色譜方案,減少工藝步驟(提高回收率)并加快純化速度,從而顯著提高生產(chǎn)率。
 

​​​​​​​   靈活放大

由于特定的整體柱設(shè)計,質(zhì)粒 DNA 過程可以快速擴展到更大的單位。 

在 1 毫升色譜柱上設(shè)計的工藝可以輕松轉(zhuǎn)移到試驗和生產(chǎn)規(guī)模。

在 8L 色譜柱上單次運行可以產(chǎn)生 48 g 藥物級 scDNA。
 

Table 2: Scale up options.

Column size

pDNA  purified per cycle

1  mL

6  mg

8  mL

48  mg

80  mL

480  mg

800  ml

4.8  g

8000  mL

48  g

 

十多年來,BIA Separations 一直是高效率質(zhì)粒純化的好選擇。它不僅提供整體柱和平臺模板,還提供定制的純化服務,以完全滿足您的質(zhì)粒 DNA 純化需求。

 

三、CIMac™分析柱

BIA的CIMac™分析柱旨在用于大分子蛋白質(zhì),質(zhì)粒DNA,樣顆粒和噬菌體的快速且可重現(xiàn)的HPLC監(jiān)測和定量。

  • 它們主要用于凈化過程不同階段的各種樣品的過程和最終控制。

  • 它們可以在高體積流量下操作(從1到20個柱體積/分鐘);

  • 因此,有關(guān)產(chǎn)品數(shù)量和純度的信息可以在幾分鐘內(nèi)獲得。

 

BIA的CIMmultus™制備柱和CIMac™分析柱是快速可靠的PAT(Process analytical technology)工具,可提供:

  • 快速,高分辨率分析,在幾分鐘內(nèi)就可以實現(xiàn)。

  • 以聚合物為基體的Monolith HPLC柱可進行獨立于流速的分離,無擴散、無微孔、無死體積,使流動相和固定相之間的傳質(zhì)非常迅速。

  • 高靈敏度和可重復性。

     

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