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由Vizgen開發和制造的MERSCOPE®系列儀器采用了突破性的MERFISH技術（Multiplexed Error Robust Fluorescence In-Situ Hybridization，多重抗錯熒光原位雜交技術），該核心技術來自哈佛大學莊小威院士實驗室，結合了smFISH（single-molecule Fluorescence In-Situ Hybridization，單分子熒光原位雜交技術）和單細胞測序的優勢，實現真正意義上的基因可視化的原位亞單細胞空間轉錄組學分析。基于超高分辨成像和MERFISH技術的MERSCOPE®系列平臺直接繪制和量化單個細胞中數百至數萬種RNA的空間分布，而無需進行下游測序。該平臺提供了研究亞單細胞空間轉錄組學的強大工具，開創了轉錄組學研究的新紀元，讓轉錄組學研究步入下一代。
MERFISH技術擴展了單分子FISH（smFISH）的功能，使用組合標記、順序成像和抗錯條形碼方案以亞微米精度檢測RNA。這為研究人員提供了了解每個細胞內轉錄組的窗口。通過MERFISH技術，可以生成RNA表達、細胞類型、細胞狀態和組織物理結構的完整生物圖譜。
該系統的抗錯條形碼方案和組合標簽確保了轉錄本的最高檢測準確性。如果背景熒光確實導致讀數錯誤，系統可以很容易地將讀數糾正到最接近的正確條形碼。雖然MERFISH不需要測序，但MERSCOPE的測量結果與bulk RNA-seq數據相關，并且在重復進行實驗時具有高度可重復性。MERSCOPE比基于陣列的平臺提供更高的檢測效率，每個基因可以多檢測出70倍的轉錄本。
MERFISH技術于2015年首次發表，截止2024年3月，應用Vizgen技術發表的高質量研究項目文獻已有200多篇，其中超過50篇影響因子大于50分，每年都有更多令人興奮的發現。憑借可靠、有價值的數據集以及值得信賴的數據質量，該技術讓科學家對空間基因組學分析充滿信心，從而推動生物學研究。
為什么要研究原位單細胞空間基因組學？為了真正理解細胞生物學和基因表達，研究人員需要能夠保持組織天然復雜性的工具。他們需要捕捉細胞的異質性，來了解組織的構成方式以及細胞之間是如何相互作用的。這就是原位單細胞空間基因組學能做到的。
借助先進的空間基因組學技術，研究人員可以在亞細胞水平上以≤100 nm的分辨率高度特異性地定位RNA轉錄本，即使對于低表達的基因也不在話下。其他技術，如單細胞測序，需要分解組織，會造成組織結構的丟失。空間基因組學技術保留了組織結構，同時提供高效的多重能力，一次可分析數百或數千個基因，從而能夠探索單份樣本中的單細胞、細胞間相互作用或組織水平結構。
MERFISH技術結合了基因組學和傳統生物標志物成像技術，其高度多重原位檢測，可通過分析在原生環境中的單細胞群體（包括常見和罕見的）來捕獲基因表達的細微差別。這是生物學的一個新維度，可以為生物體如何運作提供豐富的洞察和見解。
原位：細胞在它們的原生環境中進行分析；
單細胞：逐一分析細胞，捕捉樣本內細胞的多樣性和異質性；
空間基因組學：分析樣本中細胞的相對（空間）位置和基因表達。
通過MERSCOPE系列平臺，Vizgen將MERFISH技術與高分辨率成像、流控技術、圖像處理和自動化相結合，提供完整的端到端的空間基因組學解決方案，能獲得和完成高質量MERFISH分析所需的所有組件和培訓，包括了試劑、基因檢測組合（gene panel) 設計和軟件解決方案。用戶可根據自己的研究內容設計基因Panel的類型，具有廣泛的適用性和靈活性。
MERSCOPE Ultra特點：
1、高細胞通量：以較低的單細胞成本在單個樣本中分析多達數十萬個細胞；
2、高靈活性：能夠在多種樣本或組織切片類型上運行，包括新鮮、固定冷凍、FFPE的人類、小鼠樣本等；
3、配備2種流動室供選擇，優化成本：對于每個實驗，用戶可以從大型（FCX-L）或標準（FCX-S）流動室中進行選擇，允許用戶更好地根據成像面積匹配試劑消耗量；
4、更大的成像面積：FCX-L流動室可支持高達3.0cm2 的成像面積，而FCX-S可支持高達 1.25cm2 的成像面積；
5、更快的分析速度和高效的多重檢測：使用定制化的基因檢測組合可以在單份樣本中檢測1000個基因；每周可分析 9 cm2 的成像面積；
6、100nm的空間分辨率：覆蓋了全組織切片到單細胞和亞細胞成像；
7、無以倫比的靈敏度：以最高的檢測效率識別RNA，甚至低表達的基因也不在話下；
8、可同時檢測蛋白：兼容蛋白markers同時染色；
9、針對低質量FFPE樣本，有針對性的優化試劑化學反應解決方案，保持高靈敏度和特異性的檢測性能；
10、出色的光學部件：高分辨率光學部件可得到看上去緊湊的單個轉錄本的染色點，使點和點之間得到更好的區分并對每個細胞檢測到更多的獨特的轉錄本。
應用概述
MERSCOPE是目前唯一獲得MERFISH授權的商品化的成像分析平臺，是目前唯一的商品化的可以實現多至1000個基因檢測的原位單細胞轉錄組研究平臺。
MERSCOPE Ultra為腫瘤學、免疫學、神經科學、傳染病、發育生物學、植物學、農業、細胞和基因治療等領域廣泛的基于全組織的基礎研究和轉化醫學提供了變革性的見解，是加速藥物發現和開發的重要工具。用戶可根據自己的研究內容設計基因Panel的類型，具有廣泛的適用性和靈活性。
截止2024年3月，應用Vizgen技術發表的高質量研究項目文獻已有200多篇，其中超過50篇影響因子大于50分，全球用戶200+。
