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基因組de novo測序也叫做基因組從頭測序，是指不依賴于任何已知基因組序列信息對某個物種的基因組進行測序，然后應用生物信息學手段對測序序列進行拼接和組裝，最終獲得該物種基因組序列圖譜。
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高通量測序服務——動植物基因組測序
詳細描述：
一. 動植物基因組de novo測序
基因組de novo測序也叫做基因組從頭測序，是指不依賴于任何已知基因組序列信息對某個物種的基因組進行測序，然后應用生物信息學手段對測序序列進行拼接和組裝，最終獲得該物種基因組序列圖譜。從基因組水平上對物種的生長、發育、進化、起源等重大問題進行研究，將加深我們對物種的認識，在新基因的發現、物種改良等方面發揮巨大作用。
采用傳統的Sanger法測定高等動植物的全基因組需要花費大量的人力和物力資源，這極大限制了全基因組測序的發展。第二代高通量測序技術的成熟和廣泛應用，大大降低了基因組測序的成本，縮短了測序時間，讓更多實驗室可以獨立開展動植物基因組測序項目。
生物信息分析
1. 基因組拼裝統計
提供基因組拼裝的基本信息，包括原始數據統計、測序覆蓋率統計、Contig N50大小、Scaffold N50大小、基因組GC含量等信息。
2. 基因組注釋
包括基因預測、基因功能注釋（同NR、Swiss-prot、Interpro等數據庫進行同源比對）、重復序列分析及Non-coding RNA注釋等。
3. 基因功能分類
GO分類、KEGG通路分析等。
4. 比較基因組學及進化分析
通過比較相近物種的基因組數據，從基因功能、基因組骨架結構、分子進化等方面對目標基因組進行分析。
5. 建立數據庫
建立符合國際標準且具有良好兼容性的基因組數據庫，實現基因組數據的查詢與共享。
二. 動植物基因組重測序
在已知物種基因組的情況下，對物種內的不同個體或某個個體的不同組織進行基因組重測序，可以在全基因組水平上發現不同個體或組織細胞之間的差異。通過這種方法，可以尋找出大量的單核苷酸多態性位點（SNP），插入缺失位點（InDel，Insertion Deletion），結構變異位點（SV，Structure Variation），拷貝數變異（Copy Number Variation，CNV）等變異信息，從而獲得生物群體的遺傳特征。這對在群體水平上研究物種的進化歷史、環境適應性、自然選擇等方面具有重大意義。利用全基因組重測序有助于快速發現與動植物重要性狀相關的遺傳變異，縮短分子育種的實驗周期；有助于發現人類疾病相關的重要變異基因，加快生物醫藥研發的速度等。可以預期隨著測序成本的進一步降低以及已知全基因組序列物種的增加，重測序必將成為生命科學領域的研究利器。
生物信息分析
1. 原始數據統計
2. 短序列mapping至參考基因組
3. 分析mapping區域reads的覆蓋度、重復性、覆蓋堿基的質量及reads方向
4. SNPs、InDel、CNVs檢測
5. 結構變異（SVs）和基因組重排事件分析
美吉優勢
1. 擁有標準化操作實驗室和高通量測序技術平臺，可以根據合作伙伴要求靈活安排實驗，實驗周期短，質量可靠。
2. 擁有Roche 454和Illumina Solexa兩種高通量測序平臺，合作伙伴可根據具體需求進行選擇，以獲取最佳的實驗結果。
3. 技術人員經驗豐富，可以根據合作伙伴要求在第一時間提供實驗方案、解決實驗問題、分析實驗結果。
4. 擁有專業的生物信息團隊和大型計算機，可以為合作伙伴提供個性化的生物信息分析服務。
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