長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA,LncRNA)是一類長度超過200nt,不編碼蛋白質的RNA分子。這類RNA分子在表觀遺傳水平、轉錄水平以及轉錄后等水平調控基因的表達,廣泛參與各種生理學過程,與癌癥、心血管疾病、神經退行性疾病等多種人類疾病密切相關。目前,LncRNA已經取代miRNA成為近幾年來最耀眼的明星RNA分子,是國際上的研究熱點。
云序生物提供的LncRNA測序服務同時分析特定樣品中的所有LncRNA和mRNA,并根據已知數據庫和文獻對LncRNA進行詳細注釋,能夠幫助客戶篩選與特定生物學過程或疾病相關的LncRNA,并為后續的LncRNA功能和機制研究提供極大的便利。詳見:云序生物 lncRNA測序
云序特色
全面檢測所有LncRNA:約有20%的LncRNA沒有Poly(A)尾巴,如果采用Oligo d(T)富集法會丟失這部分LncRNA信息。云序生物擁有市面上最全的,針對不同物種的去rRNA試劑盒,能夠保留所有LncRNA
適用于降解樣品:采用特有的、可適用于降解樣品的去rRNA試劑盒,能夠最大程度地保留降解樣品中的LncRNA信息。尤其適合于臨床樣品的LncRNA檢測
鏈特異性檢測:采用鏈特異性建庫方法,可準確檢測反義LncRNA,提供最全面的LncRNA信息
專業化的生物信息學分析:強大的生物信息學團隊,滿足客戶的各類深入數據分析需求
數據分析
基本分析 |
高級分析 |
1. 原始數據整理,過濾和質量評估 |
CS-LNC-001. LncRNA靶基因共表達網絡分析(CNC) |
2. 基因組匹配與數據統計 |
CS-LNC-002. LncRNA靶基因集信號通路富集分析(LncRNA-GSEA) |
3. LncRNA識別和注釋(含mRNA) |
CS-LNC-003. LncRNA臨近靶基因GO和信號通路分析 |
4. LncRNA表達量計算(含mRNA) |
CS-LNC-004. LncRNA-miRNA-mRNA互作網絡分析 |
5. 差異LncRNA篩選(含mRNA) |
CS-LNC-005. LncRNA上游轉錄因子分析 |
6. 差異mRNA的GO和信號通路分析 |
CS-LNC-006. 新LncRNA預測 |
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CS-LNC-007. LncRNA分子標志物篩選 |
數據展示
云序服務內容
1. 測序服務
轉錄組 |
表觀遺傳組 |
基因組 |
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真核生物 |
原核生物 |
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2. 生信服務 & PCR技術服務
生信服務 |
實時定量PCR服務 |
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轉錄組 |
表觀遺傳組 |
基因組 |
聯合分析 |
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