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m1A RNA甲基化是一類新發(fā)現(xiàn)的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修飾（N1-methyladenosine，m1A）。
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m1A RNA甲基化是一類新發(fā)現(xiàn)的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修飾（N1-methyladenosine，m1A）。研究表明，m1A是真核生物tRNA和rRNA豐度很高的一種轉(zhuǎn)錄后修飾，近期研究也表明m1A修飾可調(diào)控mRNA翻譯。m1A修飾作為一類新型RNA甲基化，其功能和機(jī)制都亟待挖掘。
與m6A RNA檢測方式一致，針對(duì)m1A修飾也采用MeRIP-seq技術(shù)，首先需要用LC-MS/MS對(duì)m1A甲基化水平定量。抗體富集的技術(shù)原理如下：將m1A RNA甲基化特異性抗體與被隨機(jī)打斷的RNA片段進(jìn)行共孵育，抓取有甲基化修飾的片段進(jìn)行測序；同時(shí)需要平行測序一個(gè)對(duì)照（Input）樣本，對(duì)照樣本為未進(jìn)行IP反應(yīng)的RAN片段，對(duì)照樣本用于消除非特異性抓取甲基化片段的背景。此外，利用m1A會(huì)導(dǎo)致錯(cuò)配的特性，對(duì)抗體富集下來的片段用去甲基化酶AlkB來實(shí)現(xiàn)m1A去甲基化，對(duì)比(-)去甲基化酶和(+)去甲基化酶的結(jié)果，捕捉堿基突變的信號(hào)，來實(shí)現(xiàn)m1A甲基化修飾位點(diǎn)單堿基分辨率的鑒定。對(duì)比免疫共沉淀IP樣本和Input樣本中的序列片段，將m1A RNA甲基化修飾位點(diǎn)定位到轉(zhuǎn)錄組上，并根據(jù)RNA-seq數(shù)據(jù)，不僅計(jì)算出樣本中m1A甲基化程度，同時(shí)還可找到m1A甲基化修飾的具體位點(diǎn)信息。
1. 測序服務(wù)
2. 生信服務(wù) & PCR技術(shù)服務(wù)
與m6A RNA檢測方式一致，針對(duì)m1A修飾也采用MeRIP-seq技術(shù)，首先需要用LC-MS/MS對(duì)m1A甲基化水平定量。抗體富集的技術(shù)原理如下：將m1A RNA甲基化特異性抗體與被隨機(jī)打斷的RNA片段進(jìn)行共孵育，抓取有甲基化修飾的片段進(jìn)行測序；同時(shí)需要平行測序一個(gè)對(duì)照（Input）樣本，對(duì)照樣本為未進(jìn)行IP反應(yīng)的RAN片段，對(duì)照樣本用于消除非特異性抓取甲基化片段的背景。此外，利用m1A會(huì)導(dǎo)致錯(cuò)配的特性，對(duì)抗體富集下來的片段用去甲基化酶AlkB來實(shí)現(xiàn)m1A去甲基化，對(duì)比(-)去甲基化酶和(+)去甲基化酶的結(jié)果，捕捉堿基突變的信號(hào)，來實(shí)現(xiàn)m1A甲基化修飾位點(diǎn)單堿基分辨率的鑒定。對(duì)比免疫共沉淀IP樣本和Input樣本中的序列片段，將m1A RNA甲基化修飾位點(diǎn)定位到轉(zhuǎn)錄組上，并根據(jù)RNA-seq數(shù)據(jù)，不僅計(jì)算出樣本中m1A甲基化程度，同時(shí)還可找到m1A甲基化修飾的具體位點(diǎn)信息。
圖注：云序生物（m1A）RNA甲基化測序?qū)嶒?yàn)流程
云序生物 （m1A）RNA甲基化測序產(chǎn)品
云序優(yōu)勢
技術(shù)優(yōu)勢：
可單堿基分辨率檢測m1A甲基化修飾
特異性高：
m1A RNA-seq采用商業(yè)化m1A抗體，可特異性富集m1A修飾片段
一站式服務(wù)：
客戶只需提供細(xì)胞、組織、體液或總RNA，云序生物為您完成從m1A RNA-seq富集、文庫制備、上機(jī)測序到數(shù)據(jù)分析的整套服務(wù)流程
專業(yè)的生物信息學(xué)分析：
云序生物具有強(qiáng)大的生物信息學(xué)團(tuán)隊(duì)，能夠滿足客戶的各類深入數(shù)據(jù)分析要求
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技術(shù)優(yōu)勢：
可單堿基分辨率檢測m1A甲基化修飾
特異性高：
m1A RNA-seq采用商業(yè)化m1A抗體，可特異性富集m1A修飾片段
一站式服務(wù)：
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專業(yè)的生物信息學(xué)分析：
云序生物具有強(qiáng)大的生物信息學(xué)團(tuán)隊(duì)，能夠滿足客戶的各類深入數(shù)據(jù)分析要求
1. 測序服務(wù)
2. 生信服務(wù) & PCR技術(shù)服務(wù)
| 生信服務(wù) | 實(shí)時(shí)定量PCR服務(wù) | |||
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| lncRNA分析 | ChIP測序分析 | 微生物菌落分析 | LncRNA-mRNA | 環(huán)狀RNA實(shí)時(shí)定量PCR |
| mRNA分析 | 宏基因組分析 | LncRNA-miRNA-mRNA | LncRNA實(shí)時(shí)定量PCR | |
| microRNA分析 | miRNA實(shí)時(shí)定量PCR | |||
| mRNA實(shí)時(shí)定量PCR | ||||
手機(jī)版：m1A RNA甲基化測序
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