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ASA-750K芯片
是 Illumina 首款基于9000+東亞人全基因組測序數據設計的全基因組 SNP 芯片,該芯片包含70萬個標記,是迄今為止對東亞地區的低頻 突變體(MAF 為 1%~5%)覆蓋度最佳的芯片
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最后更新:2020-10-16半年訪問:88
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 ASA-750K芯片

ASA(Asian Screening Array)芯片是 Illumina 首款基于9000+東亞人全基因組測序數據設計的全基因組 SNP 芯片,該芯片包含70萬個標記,是迄今為止對東亞地區的低頻 突變體(MAF 為 1%~5%)覆蓋度最佳的芯片;諾禾在此基礎上新增了5.5萬個特有的標記。

位點信息

基因組骨架(550K):9000+亞洲人15~30× 全基因組測序數據;疾病/性狀相關位點。
臨床研究位點(100K):常見疾病、HLA、藥物基因組相關等。
探索性研究(50K):非臨床相關基因的外顯子區域。
樣本指控(10K):血型判斷、性別。
定制位點(50K):疾病相關位點;性染色體位點。

科學方案設計

從材料選取、探針捕獲、到檢測分析,每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。
結果展示

表1 ASA 芯片分型結果

Chr:染色體編號       Pos:染色體上位置信息       ID:位點物理信息       Sample 1~3:樣本1~3

表2 ASA 芯片樣本信息統計

Sample ID:樣本ID       Call Rate:檢出率       Gender:性別       Sample Name:樣本名稱

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