,艾吉泰康生物科技(北京)有限公司">
致力于為基因組編輯領域的科研工作者提供優質、快速和精準的sgRNA設計合成方案,并精準預測脫靶位點,結合具有自主知識產權的捕獲技術進行快速、準確和成本集約的脫靶位點鑒定。
|
||||||||||||||||||
[發表評論] [本類其他服務] [本類其他服務商] |
服務商: 艾吉泰康生物科技(北京)有限公司 | 查看該公司所有服務 >> |
隨著基因編輯技術在基礎研究、基因治療、分子育種等多領域的快速推進和應用,如何正確預測、評估和降低脫靶效應的發生,如何對編輯后的脫靶情況進行有效驗證和鑒定,成為了困擾眾多基因編輯科研工作者的重要課題。iGeneTech®具有行業頂尖的設計專家團隊和國際領先的高通量、高保真、高均一性的sgRNA文庫合成技術,致力于為基因組編輯領域的科研工作者提供優質、快速和精準的sgRNA設計合成方案,并精準預測脫靶位點,結合具有自主知識產權的捕獲技術進行快速、準確和成本集約的脫靶位點鑒定。
產品優勢
◇ 優化的sgRNA設計方案,有效降低脫靶效率: 行業頂尖的設計專家團隊,優化的基因組編輯設計方案,使設計出的sgRNA擁有更低的脫靶效率和更高的編輯效率。 |
◇ 文庫合成正確率高、性能穩定: 采用國際領先高能通量合成技術,小于1/200的錯誤率,確保合成的高保真性、高均一性。 |
◇ 脫靶位點鑒定全面、精確: 脫靶位點多重PCR引物設計成功率大于98%,每個位點測序深度大于10000 X 。 |
服務項目 |
周期(工作日) |
優勢 |
sgRNA文庫設計 |
1 |
專家團隊、免費設計 |
sgRNA文庫合成 |
15 |
領先的高通量合成技術、低錯誤率、高保真度 |
脫靶位點預測 |
- |
全方位精準預測 |
CRISPR脫靶檢測 |
15 |
全面、精確、快速的脫靶位點鑒定 |
案例一 CRISPR sgRNA的設計和脫靶搜索工具 CRISPR-offinder
發表雜志:International Journal of Biological Sciences IF:3.873 發表年份:2017
CRISPR/Cas9系統廣泛用于基因組編輯,但是這些核酸酶經常會導致不期望的off-target,而sgRNA很大程度上決定了編輯的特異性。華中農業大學與艾吉泰康聯合開發了一款用戶可自定義PAM的CRISPR sgRNA設計和脫靶效應評估軟件--CRISPR-offinder。CRISPR-offinder設計的sgRNAs可以適配滿足不同類型的RNA引導的DNA內切酶。該軟件程序中包括4個部分:
a、設計sgRNAs,sgRNAs靶位點的長度為15-25nt;
b、PAM需求:默認的PAM和用戶自定義PAM,用以確認PAM的序列、方向和坐標;
c、投入參數CRISPR-offinder提供兩個選項用于輸入基因或基因組序列;
d、非目標搜索參數。
CRISPR-offinder可以支持任意物種的sgRNA文庫設計,不受該物種基因組組裝狀態的影響。實驗表明,對于不同的CRISPR系統,包括最新發現的基因編輯方法,如Cpf1和C2c1,CRISPR-offinder設計得到的sgRNA均能有效降低脫靶效應。
圖1 不同基因組編輯系統與CRISPR-offinder軟件工作原理圖
參考文獻
Zhao C, Zheng X, Qu W, et al. CRISPR-offinder: a CRISPR guide RNA design and off-target searching tool for user-defined protospacer adjacent motif[J]. International Journal of Biological Sciences, 2017, 13(12):1470-1478.