1.投量一般是按摩爾數(shù)比來算的,大概是需要接入氨基的個數(shù)的2倍投量。用這個方法換算的話,因為不知道 IRB-NHS 里面含有幾個活性酯,所以具體的量無法確定。
答復(fù):每個IRB-NHS中只有一個活性酯,但由于IRB-NHS本身水解作用,其投料比往往控制在伯氨基的1.5-2.0倍左右。
2.標記抗體時,抗體與染料的投料比是多少?
答復(fù):是1:3(摩爾比),大概每個抗體上可以標記1個左右熒光基團。
3.想用這個染料修飾的材料的分子結(jié)構(gòu)式中含有氨基(伯胺)和羧基,有兩個問題:
1)羧基會不會參與反應(yīng)?如果會的話我需要如何處理?
答復(fù):羧基不會參加反應(yīng),IRB-NHS只與待標記材料中的伯氨基反應(yīng)生成穩(wěn)定的酰胺鍵。
2)這種染料在與伯胺反應(yīng)后,水溶性如何,還會有何種水溶性基團。
答復(fù):熒光基團本身含兩個磺酸基,其水溶性很好,不會現(xiàn)在改變所標記材料的水溶性。
4.該染料的分子結(jié)構(gòu)信息,可否提供?
答復(fù):母核是花菁類染料,可以提供其基本結(jié)構(gòu)。
5.關(guān)于“配制的DMF稀釋液需立即使用。存放導(dǎo)致活性迅速喪失”這個說明,染料標記上靶分子以后,熒光可以持續(xù)多久?
答復(fù):活性喪失主要是指活性NHS酯基基團破壞,無法與待標記材料商氨基鍵合,并非指熒光信號本身消失。連接上目標材料后,低溫避光保存,固體狀態(tài)熒光可以維持數(shù)月,液體狀態(tài)數(shù)周。
6.有一個實驗方案如下:標記的是一個多肽,共61個氨基酸,大小為6.6KD。
1)多肽溶于無菌PBS中,終濃度為10 mg/ml。
2)將0.2mg IRB-NHS 粉末配置成 DMSO 溶液( 0.01 mg/uL)。
3)將配置好的20ul染料立即逐滴分別滴加至200ul 10mg/ml 多肽溶液中,至于搖床,室溫反應(yīng)2 h。
4)反應(yīng)結(jié)束后,反應(yīng)液加入超濾管中進行超濾( 4000 rpm,30×3min )取超濾管上層溶液。
5)尾靜脈注射SCID小鼠,100ul IRB-NHS -V5/mice
請問這個方案合理嗎?
答復(fù):該方案基本合理。反應(yīng)環(huán)境pH可以控制在7.4-8.3之間。IRB-NHS使用量(摩爾數(shù))應(yīng)為根據(jù)每條多肽期望的熒光基團個數(shù)的兩倍量。另要確保多肽上有足夠的伯胺基可以與NHS活性酯反應(yīng)。另外,盡量避免多肽上功能區(qū)域的胺基與熒光基團反應(yīng)從而影響多肽活性。反應(yīng)結(jié)束后,建議純化后觀察材料顏色。成功標記后的材料應(yīng)該呈深綠色。
7.抗腫瘤抗體,190KD,想做近紅外靶向成像實驗,抗體和染料的比例是多少?在尾靜脈100ul情況下打入的抗體應(yīng)該控制到多少摩爾,多少質(zhì)量會有比較好的成像效果?感覺最重要的環(huán)節(jié)就是比例和用量,不然小分子多的話靶向性真的體現(xiàn)不好,其他代謝部位都有擴散。
答復(fù):一般每個抗體上標記2-5個近紅外熒光分子就能夠很好進行成像。抗體注射劑量與診斷和治療目標有關(guān),有很多文獻可以查到!標記到抗體上的熒光基團由于數(shù)量很少,不會對抗體靶向性產(chǎn)生影響!
8.激發(fā)波長對實驗結(jié)果影響多大?有的儀器沒有789nm的波長?
答復(fù):最佳條件是在探針最大吸收處激發(fā),但在730-780 nm處激發(fā)都有較強信號!
9.感覺這個固體粉末是不時間稍久就會沾到管壁上,上次做的時候,用的是實驗室?guī)熜忠郧百I的,但都沾到了管壁上,不能夠?qū)嶋H稱量,我就用DMSO溶解了,但感覺比例就加的不對了,染料可能加多了,胃腸處的熒光強度太強,都曝紅曝白了
答復(fù):活體注射是要摸索劑量的。該探針由于含有NHS基團,不宜長期存放,建議購買后3個月內(nèi)使用!不能配成溶液后存放!
10.在染料和抗體偶聯(lián)完后,三次超濾后仍見超濾下來的液體是綠色,是否為染料加入過多?是否要超濾到無色為止?
答復(fù):最好超濾液中不要有明顯綠色!但也有可能是濾膜不好導(dǎo)致抗體濾出導(dǎo)致顏色。
11.如果多肽分子量太小,1.5KD 用什么純化方法比較好?可以用HPLC純化嗎?
答復(fù):一般利用層析柱分析。根據(jù)分子量差異進行分離。探針分子量為800,所以很容易進行分離。
12.多肽是1400,不好分啊?cy5.5可以用HPLC不知道你們的這個可以不?HPLC對偶聯(lián)后的多肽和IR影響大嗎?
答復(fù):1400和標記熒光基團后的2200還是可以用層析住分的。分子量還是差別較大的。也可以用HPLC分。不過更耗時一些。
13.1.4KD的多肽和IR783耦連后,如何把多余的IR783去除掉?具體一點的方法。
答復(fù):利用標記前后分子量不同可以通過柱層析分離。