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在創新 HTRF 測定開發中采用低體積液體處理自動化的成本效益分析

瀏覽次數:909 發布日期:2023-10-10  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
介紹
 
免疫測定法的開發非常具有挑戰性,這是因為獲得特定信號需要正確組合樣品和檢測底物。
 
多年來,Cisbio 開發了數百種測定方法。在本應用說明中,我們將展示 MANTIS® 液體處理器及其大容量芯片更換器 (LC3) 配件如何幫助我們在以下所有關鍵點上改進我們的工藝:可重復性、時間、成本和減少操作者肌肉骨骼疾病。在這里,我們將重點介紹兩種類型的均相時間分辨熒光 (HTRF)®檢測分析:生物標志物和磷蛋白分析。 HTRF 將 TR-FRET(時間分辨熒光共振能量轉移)的熒光靈敏度、時間分辨率和低背景特性與 FRET(熒光共振能量轉移)的同質性結合在一起。
 

圖 1. MANTIS 液體處理器 和 LC3
 
背景知識
 
HTRF 使用兩個熒光團,一個能量供體和一個能量受體,它們在彼此靠近時轉移能量。這創建了一種同質的測定形式,其中結合和未結合的分子不需要分開,因為來自受體的熒光發射僅在分子結合時產生。
 
每種測定都使用夾心形式,其中兩種抗體用HTRF專用熒光團標記。生物標志物檢測使用兩種對目標蛋白質具有特異性的抗體(參見圖 2A),而磷蛋白分為兩種測定方法(參見圖2B)。其中第一個測定方法是磷酸化試劑盒,在試劑盒中一種抗體靶向磷酸化位點,而另一種抗體靶向整個蛋白質。
 
 

圖 2A. 生物標志物測定的測定形式
 
 
圖 2B. 磷酸化和總測定的測定形式
 
磷蛋白測定中的第二個測定方法是總測定試劑盒,它使用兩種抗體靶向目標蛋白上的兩個獨立表位。為了獲得一對功能正常的抗體配對,我們通常篩選 10 種抗體用于生物標志物測定。每種抗體都用熒光團、穴狀化合物和d2標記。HTRF 供體熒光團穴狀化合物由稀土配合物組成,其中嵌入了鑭系離子,如銪或鋱,并產生 1 至 2 毫秒范圍內的長壽命發射,這是時間分辨檢測的基本特征。d2 HTRF 受體由于其小尺寸和設計,在免疫競爭性測定中具有更高的穩定性,并且在某些情況下會提高測定靈敏度。
 
對于磷酸化蛋白分析,我們測試了五種磷酸化抗體和五種總抗體。
 
為了測試這些抗體配對,我們使用重組蛋白作為生物標志物,使用細胞裂解物作為磷酸化蛋白。這些樣品中的每一個都被稀釋兩次以評估動態范圍。這些稀釋會在最終用戶實施的培養基中進行(例如,用于分泌生物標志物的培養基,或用于細胞內磷酸蛋白的裂解緩沖液)。由于HTRF使用同質形式的一步檢測實驗方案,因此緩沖區組成可能對信號產生巨大影響。因此,我們開發了 4 種裂解緩沖液來匹配任何抗體對去污劑的敏感性。
 
討論
 

在使用MANTIS之前,我們使用 384 孔板,一式三份。所有這些孔板加起來,其中1080 個孔將留給生物標志物試劑盒 ,3360 個孔留給為磷酸化/總篩選。3 到 9 號之間的微孔板編號 (見圖3)。
 
 
圖 3. 生物標志物和磷/總測定的抗體配對匹配
 
此實驗設計不可能在一次操作中完成,而且最多需要 3 天才能進行一次篩選。因為多通道移液器不適合我們的操作,所以我們使用重復液體分配器完成這些操作,比如Eppendorf的Multipette。2 µL 精確分液的精度太低,板孔之間的交叉污染過多。
 
因此,對于單塊384 孔板,需要混合三種試劑,每塊板總共有 1152 次移液動作。一年后,操作者的肌肉骨骼疾病成為了我們實驗室的一個真正需要正視的問題。
 
由于 MANTIS 能夠分配到 1536 孔板形式中,因此我們能夠按比例縮小 1536 孔尺寸的測定體積。
 
我們能夠將體積從 16 µL 樣品和 2 µL 每種抗體減少到 4 µL 樣品和 0.5 µL 每種抗體,而不會造成任何損失。此外,由于MANTIS 分配 5 µL 比分配 4 µL 更快,我們選擇了它來完成我們的實驗方案。(見 圖 4)
 



圖 4. HTRF測定在信號和變異系數方面的比例縮小
 
所以,我們準備好了。使用 1536 孔板,一次完整的篩選只需要 1 到 3塊微孔板,每塊板只需大約 30 分鐘即可完成分配。這個時間還包含了自動芯片清洗時間,在這段時間內用戶可以自由地做其他事情。顯示實驗設置的磷蛋白測定示例和結果如下所示 (見 圖 5)。
 
圖 5. 磷/總測定的最佳抗體配對結果示例
 
總結
 
在一年多的工作里我們對這些改進進行了總結,這些總結包含了針對每種類型的至少十個項目,我們在許多層面上節省了時間、金錢和大量的勞動。
 
在使用MANTIS 之前,這些項目消耗了 130塊384 孔板。通過改用 1536 孔板,我們成功將消耗的板數量減少 75%。(見 圖 6A)。這一數量的板轉為總共分配的44400個板孔。 每個板孔需要三次分液,總共13.32萬次,這些全部由MANTIS操作完成,而非人工操作(見 圖 6B)。
 
 
圖 6. (A) 超過 20 個項目所使用的微孔版數量。
 (B) 手動分配微孔板的數量。 
(C) 所用消耗品的成本。
(D) 使用的抗體量。
 (E) 最佳抗體配對篩選所用的時間。
 
由于 MANTIS 芯片被設計成能夠清潔和使用多達 100 萬次分液循環,因此我們不必再擔心耗材成本 (見圖6C)。以前我們使用非常昂貴的重復分液器吸頭,但是,當使用 MANTIS時,我們只需要一個標準吸頭來處理在使用時添加到芯片中的每種試劑。我們還減少了試劑浪費,因為通常試管中的死體積可達 200 µL,但使用MANTIS,其死體積僅有 20 µL。再加上通過將 HTRF 試劑體積除以四來縮小我們的測定規模,我們節省了超過 1500 µg 的標記抗體 (見圖 6D)。 
 
還通過在一次操作中進行全面篩選,我們估計節省了 25 天的手動工作量,這樣就不必拆分操作以便由研究人員手動執行(見圖6E)。手動分配需要許多控制和校正步驟,而 MANTIS 提高了可靠性,且將誤差降至最低。
 
總之,MANTIS 正在成為我們實驗室真正的游戲規則改變者。液體處理器使我們能夠在各個方面改進我們的流程,考慮到一些我們熟知的不可能手動執行的操作,MANTIS會幫助到我們開辟新的可能性。
發布者:富默樂國際貿易(上海)有限公司
聯系電話:021-61562961
E-mail:tiefeng2@163.com

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