質譜儀的發展過程簡介及其工作原理的介紹
質譜儀可能小如一枚硬幣，也可能占據一個非常大的房間。盡管各種儀器類型用于截然不同的應用，但它們的一部分工作原理仍是相同的。現已采用道爾頓(Da)取代其他術語（例如amu）作為質譜測量單位。1 Da = 一個碳12 (12C)同位素原子質量的1/12。
過去質譜儀只用作輔助化合物鑒定的定性設備，人們一度認為它不能準確定量。但近年來，質譜儀已被證實是一種集定性和定量能力于一體的儀器。
使用質譜儀測定分子的質量時必須先將分子轉化為氣相離子。為此，質譜儀會向分子傳遞電荷，并將由此產生的帶電離子流轉換為成比例的電流，然后通過數據系統讀取該電流。數據系統將電流轉換為數字信息，以質譜圖的形式呈現。
可以通過多種適合目標分析物的方式生成離子：
將溶于基質的化合物上樣至平坦表面進行激光燒蝕，例如MALDI
讓化合物與高能粒子或電子相互作用，例如電子轟擊電離(EI)
將電離作為傳輸過程本身的一部分，例如我們已經了解的電噴霧電離(ESI)技術會對液相色譜儀的洗脫液施加高壓，從而在氣溶膠中生成離子
質譜儀將根據離子的質荷比(m/z)對離子進行分離、檢測和測定。繪制相對離子流（信號）與m/z的關系圖，生成質譜圖。小分子通常只帶一個電荷：因此m/z是質量(m)除以1的值。“1”代表電離過程中添加的質子[表示為M+H+，如果通過失去質子形成離子，則為M-H-]，如果離子是通過失去電子形成的，則表示為自由基正離子[M+.]。不同質譜儀的準確度或實際測定真實質量的能力可能會有所不同，相關內容請參閱本入門指南的后面部分。
較大的分子在其結構內的多個位置捕獲電荷。小分子肽通常可帶兩個電荷(M+2H+)，而非常大的分子有許多位點，因此可以通過簡單的算法來推斷譜圖出現的離子的質量。
經正確校準后，低分辨率儀器可以提供非常準確的質量數，但由于分辨率空間有限，隨著數據堆集，可提供的有關譜圖的信息也逐漸減少。緩激肽（一種9氨基酸肽）的常見代謝片段BK1-5（即Arg-Pro-Pro-Gly-Phe，是一種ACE（血管緊張素轉化酶）抑制劑，用于擴張血管）可攜帶兩個電荷（單電荷(M+H)產生單同位素質量數573.3149，而雙電荷版本(M+2H)的質量數為287.1614）。同位素帶雙電荷，也開始填充可用的分辨率空間。
可分析的分子大小上限是多少？
解吸方法（已在本入門指南中介紹）擴展了分析大分子、非揮發性、易碎分子的能力。在40,000 Da范圍內以0.01%的準確度（或4 Da以內）進行常規檢測可以確定微小的變化，例如翻譯后修飾。多電荷態使質譜儀遠遠超出其設計范圍上限，包括1,000,000 Da及以上的質量。
同位素和元素質譜
天然同位素豐度已得到充分表征。盡管通常認為該參數較穩定，但它仍然可以顯示出顯著的特征差異。同位素比測定被用于代謝研究（使用富含同位素的元素作為示蹤劑）以及氣候研究（測定與溫度相關的氧和碳變化）。在實際應用中，使用高精度功能（如扇形磁場儀器上的功能）分析復雜分子之前要先將其碎裂為簡單的分子組分（請參閱下一節）。
元素分析通常用于分析無機材料 - 旨在確定元素組成，而非結構 - 在某些情況下使用固體金屬樣品。在使用放電裝置（或低功率輝光放電裝置）來電離樣品的應用中，電感耦合等離子體(ICP)離子源很常用。使用專用儀器在ppt水平行檢測的應用并不少見。
天然同位素豐度已得到充分表征。盡管通常認為該參數較穩定，但它仍然可以顯示出顯著的特征差異。同位素比測定被用于代謝研究（使用富含同位素的元素作為示蹤劑）以及氣候研究（測定與溫度相關的氧和碳變化）。在實際應用中，使用高精度功能（如扇形磁場儀器上的功能）分析復雜分子之前要先將其碎裂為簡單的分子組分（請參閱下一節）。
元素分析通常用于分析無機材料 - 旨在確定元素組成，而非結構 - 在某些情況下使用固體金屬樣品。在使用放電裝置（或低功率輝光放電裝置）來電離樣品的應用中，電感耦合等離子體(ICP)離子源很常用。使用專用儀器在ppt水平行檢測的應用并不少見。
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