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ABI 3730XL測序平臺的原理及特點

瀏覽次數:13502 發布日期:2011-6-8  來源:上海美吉生物醫藥科技有限公司

Applied Biosystems 3730XL測序儀是高質量的長片段讀取序列分析的測序平臺,應用靈活而廣泛。3730XL可同時分析96個樣品,該儀器采用4色熒光同時檢測,可不間斷24小時運行,自動灌膠,上樣,電泳分離,檢測及數據分析。儀器除了能夠完成新基因測序工作或比較測序工作外,還可進行多種片段分析,包括微衛星 DNA 分析,比較基因型分析,單核苷酸多態性 (SNP) 研究等。

                                       

ABI 3730XL測序儀

測序峰圖

雙脫氧鏈終止法原理

    雙脫氧鏈終止法又稱為Sanger法,其原理是DNA模板在DNA聚合酶、引物、四種脫氧核苷酸三磷酸(dNTP)存在下進行復制時,在四管反應體系中分別按一定的比例引入四種雙脫氧核苷三磷酸(ddNTP)由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基團,ddNTP摻入鏈的末端時,該鏈就會停止延伸。如此每管反應體系中就產生了一系列長度不等的以ddNTP3端的DNA片段。反應終止后,分4個泳道進行凝膠電泳以分離長短不一的DNA片段,相鄰的片段長度相差一個堿基。經放射自顯影后,根據片段3’端的雙脫氧核苷,便可獲得合成片段的堿基排列順序。

Sanger法測序原理圖

ABI 3730XL測序儀技術原理

ABI 3730XL自動測序儀是基于毛細管電泳和熒光標記技術的DNA測序儀。基于Sanger法,3730XL測序儀擁有96道毛細管,并用熒光標記代替了同位素標記,從而大大提高了DNA測序的速度和準確性。4種雙脫氧核苷酸(ddNTP)的堿基分別用不同的熒光進行標記,在通過毛細管時不同長度的DNA片段上的4種熒光基團被激光激發,發出不同顏色的熒光,被CCD檢測系統識別,并直接翻譯成DNA序列。

儀器特點

1. 雙光束雙側激光激發,光柵分光裝置和后置超薄CCD檢測成像系統。

2. 自動灌膠、上樣、電泳分離、檢測及數據分析,可連續運行24小時無需人工干預。

3. 一次電泳測定96個樣品,一天可跑12次測序電泳,每天的測序產率是1152個樣品。

4. 自動堿基識別、基因型分析與質量評分判定。

5. 最新POP-7液體分離膠,動態內鍍毛細管壁使讀序長度達1000bp以上,精確讀序達800bp

6. 良好的溫控裝置提供了更大的溫控范圍(18~70),電泳溫度可達70,有助于去除二級結構的影響

7. 高靈敏度減少DNA和測序試劑的使用量

8. 更高的自動化減少勞力成本及人為失誤的成本。

技術應用

1. 菌液、質粒、PCR產物測序

2. Fosmid/Cosmid/BAC雙末端測序

3. 大片段鳥槍法測序

4. EST測序和分析

5. 步移測序

6. SNP發現和重測序

7. STR分型

 

 

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