上海交通大學和美國約翰霍普金斯大學的研究人員利用廣州博翀生物科技有限公司生產(chǎn)的大腸桿菌蛋白質組芯片，發(fā)現(xiàn)了一種全新的蛋白質 去乙酰化酶 YcgC ，這一研究成果2015年12月30日在eLIFE雜志在線發(fā)表。  
 

蛋白質是生命活動的體現(xiàn)者，在生命周期中往往會被打上不同類型的修飾。乙酰化作為一種重要且廣泛存在的蛋白質翻譯后修飾類型，與一系列重要疾病密切相關，影響眾多關鍵的生物學過程。隨著蛋白質組技術的進步，目前已經(jīng)從低等的大腸桿菌到高等的人等眾多生物的細胞中發(fā)現(xiàn)了成千上萬的乙酰化修飾。蛋白質的乙酰化由乙酰轉移酶和去乙酰化酶所調控。對應海量的蛋白質乙酰化修飾，目前已知的乙酰化酶和去乙酰化酶數(shù)目非常有限，仍有相當數(shù)目的新酶有待發(fā)現(xiàn)，一個關鍵問題是“如何實現(xiàn)高效乙酰化相關酶的發(fā)現(xiàn)？”。 

針對這一問題，研究者發(fā)展了一套稱之為“Clip-chip”的技術，在大腸桿菌蛋白質組芯片的基礎上，進行了全局性蛋白質去乙酰化酶的研究，發(fā)現(xiàn)了一種新的去乙酰化酶YcgC。該酶能夠非常高效地去除底物蛋白RutR賴氨酸52位和賴氨酸62位的乙酰化。已知的蛋白質去乙酰化酶的活性依賴于NAD⁺或者Zn²⁺，但YcgC的去乙酰化活性并不依賴于以上兩者。進一步的功能實驗表明，YcgC通過去乙酰化影響RutR的轉錄調控活性。在實驗中研究者還發(fā)現(xiàn)RutR具有蛋白酶活性，YcgC通過去乙酰化能夠調節(jié)RutR的蛋白酶活性。研究者比較了YcgC與大腸桿菌中唯一的去乙酰化酶CobB對大腸桿菌表達譜的影響，結果表明，兩者既有相似點，也有較大的不同，提示YcgC的底物譜與CobB的可能有較大的不同。通過全基因合成，研究者獲得了來源于多個其它細菌的大腸桿菌YcgC的同源基因克隆，表達測試表明這些克隆所表達的蛋白均具有蛋白質去乙酰化酶活性。

該研究所發(fā)現(xiàn)的YcgC可能代表一個全新的蛋白質去乙酰化酶家族。同時該研究中所發(fā)展的Clip-Chip技術具有通用性，可方便地移植于其它酶的發(fā)現(xiàn)中。  

 

該研究中所用的大腸桿菌蛋白質組芯片已由 廣州博翀生物科技有限公司完成轉化生產(chǎn)，希望為更多的研究者提供這一組學研究工具！  

 

原文鏈接：http://elifesciences.org/content/4/e05322