圖1 . loxP位點及其突變體位點[1]
根據(jù)lox位點的排列方向和位置,Cre重組酶能介導片段發(fā)生刪除、倒轉和易位三種重組事件:
Deletion(刪除):當兩個Lox位點在同一染色體上且方向相同時,兩個Lox位點之間的序列將被刪除。
Inversion(倒轉):當兩個Lox位點位于同一染色體上且方向相反時,兩個Lox位點之間的序列將發(fā)生序列倒轉。
Translocation(易位):當兩個Lox位點位于不同的染色體上且方向相同,將導致2條染色體上DNA片段的交換。
圖2. Cre的重組機制[2]。A)loxP位點的基本結構。紅色箭頭指示loxP位點的方向。B)Cre-loxP介導的易位重組。C)左圖示Cre介導兩同向loxP位點間的切除重組。右圖示Cre介導兩反向loxP位點間的反轉重組。
2. 體內Cre-lox系統(tǒng)的基礎應用
利用Cre-lox系統(tǒng)在小鼠體內實現(xiàn)對基因的時空特異性打靶(表達或敲除),原則上需要建立兩種小鼠。
一是Cre工具鼠,該小鼠為攜帶Cre重組酶的基因修飾小鼠。其中,Cre重組酶由特定啟動子驅動,可在特定細胞或組織中表達;二是Flox小鼠,即在靶基因序列兩側插入Lox位點的基因修飾小鼠。通過將上述兩種小鼠交配繁育,即可獲得基因條件性敲除或過表達小鼠。
2.1 基因條件性表達
在基因條件性表達中,F(xiàn)lox小鼠的靶基因與啟動子之間通常插入了一個“終止盒”(lox-stop-lox-GENE)。該元件能阻止靶基因的轉錄和表達。將Flox小鼠與細胞類型特異性表達Cre的工具鼠交配所獲得的子代小鼠中,所有表達Cre重組酶的細胞,stop元件會被刪除。因此,靶基因僅在這些特定細胞中得以表達。
圖3. 條件性基因表達小鼠原理示意圖[3]
2.2 基因條件性敲除
在基因條件性表達中,F(xiàn)lox小鼠一般在需要刪除的DNA片段兩側帶有同方向的兩個Lox位點(lox-GENE-lox)。將Flox小鼠與細胞類型特異性Cre小鼠交配所獲得的子代小鼠中,所有表達Cre重組酶的細胞,該DNA片段會被刪除。
圖4. 條件性基因敲除小鼠原理示意圖[3]
3. 更精準的誘導型Cre-lox系統(tǒng)
為更準確地進行遺傳功能研究,時間特異性的Cre-lox(也叫誘導型Cre-lox)被開發(fā)出來,可用于研究生物體發(fā)育過程特定階段的基因功能,或用來進行譜系示蹤等。常用誘導型Cre-lox系統(tǒng)有:
3.1 CreER系統(tǒng)
通過他莫昔芬(Tam)誘導Cre酶的重組活性。在沒有他莫昔芬的情況下,CreER融合蛋白與熱休克蛋白90(HSP90)相互作用并存在于細胞質中(圖5.1)。給予他莫昔芬藥物處理會破壞HSP90與CreER的相互作用(圖5.2)。ER與Tam的相互作用誘導Cre的核易位(圖5.3)。在細胞核中,CreER識別loxP位點(圖5.4)并使組織X中的基因Y失活(圖5.5)。CreERT2在體內對藥物誘導的敏感性更高,因此一般優(yōu)選使用CreERT2。
圖5. 他莫昔芬(Tam)誘導的Cre系統(tǒng)[4]
3.2 Cre;Tet系統(tǒng)
四環(huán)素誘導系統(tǒng),也叫強力霉素(Dox,四環(huán)素衍生物)誘導的Cre系統(tǒng)。該系統(tǒng)有兩種模式:Tet-on和Tet-off,分別是Dox依賴性Cre的激活和Dox依賴性Cre的失活。Tet系統(tǒng)包括以下元件:反向四環(huán)素控制反式激活因子(rtTA);四環(huán)素控制反式激活因子(tTA);四環(huán)素響應元件(TRE),通常是19個核苷酸的四環(huán)素操縱子(tetO)序列的7個重復,調節(jié)Cre基因的表達。Dox通常在小鼠的飼料或飲水中進行給藥。
Cre;Tet-on系統(tǒng):Dox給藥才能打開Cre表達。在Tet-on系統(tǒng)中,表達普遍存在的或組織特異性的啟動子驅動的rtTA。在沒有Dox的情況下,失活的rtTA無法與負責調控Cre基因的TRE序列結合,則Cre不表達。在Dox給藥之后,Dox結合并激活rtTA。激活的rtTA與TRE序列結合并誘導Cre表達。
圖6. Dox誘導的Cre;Tet-on系統(tǒng)[4]
Cre;Tet-off系統(tǒng):Dox給藥后關閉Cre表達。在Tet-off系統(tǒng)中,在沒有Dox的情況下,激活的tTA能夠結合Cre前的TRE序列并誘導Cre表達。而在Dox給藥后,與Dox相互作用的tTA被滅活。滅活的rTA不再與TRE結合,因此Cre表達受到抑制。
4. 南模生物Cre/Dre工具鼠庫
南模生物可提供超過600多種自主產權Cre/Dre工具鼠,覆蓋全身各類型的細胞組織,滿足科研人員多樣化的需求。同時,我們還在對Cre/Dre工具鼠進行全面的驗證,目前已經完成了200多種Cre/Dre工具鼠的驗證工作。
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部分Cre品系驗證數(shù)據(jù)如下:
1 Alb-CreERT2
Alb-CreERT2小鼠是研究肝臟基因功能與疾病的重要小鼠品系,驗證數(shù)據(jù)證明Alb-CreERT2小鼠可以成為實現(xiàn)肝臟時間特異性敲除或表達的工具鼠。
圖8. Alb-CreERT2; Rosa26-LacZ小鼠肝組織X-gal染色。未使用他莫昔芬誘導的小鼠,肝細胞未被染色;使用他莫昔芬誘導的小鼠,肝細胞成功著色。
圖10. Alb-CreERT2小鼠血生化檢測。結果顯示Alb-CreERT2小鼠與野生型小鼠相比肝功能正常。
2 Pvalb-Cre
Pvalb-Cre在中間神經元中表達iCre重組酶,而不干擾內源性Pvalb表達。這些小鼠可能對研究神經元分化有重要作用。
圖11. 熒光檢測PvalbCre+/-; Rosa26tdTomato+/-小鼠大腦皮層中間神經元tdTomato的表達。
圖12. 熒光檢測PvalbCre+/-; Rosa26tdTomato+/-小鼠海馬中間神經元tdTomato的表達。結果顯示:雙陽性小鼠海馬中間神經元有tdTomato的表達,表達類型符合預期。
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下一期我們將深入探討Cre-lox系統(tǒng)的常見問題及飼養(yǎng)繁育技巧,感興趣的朋友可關注下方微信公眾號,即時獲取專業(yè)指導與實用干貨,加速您的研究進程!
References
關于我們
上海南方模式生物科技股份有限公司(Shanghai Model Organisms Center, Inc.,簡稱"南模生物"),成立于2000年9月,是一家上交所科創(chuàng)板上市高科技生物公司(股票代碼:688265),始終以編輯基因、解碼生命為己任,專注于模式生物領域,打造了以基因修飾動物模型研發(fā)為核心,涵蓋多物種模型構建、飼養(yǎng)繁育、表型分析、藥物臨床前評價等多個技術平臺,致力于為全球高校、科研院所、制藥企業(yè)等客戶提供全方位、一體化的基因修飾動物模型產品解決方案。