1. 培養法
設備成本：低（需培養箱、顯微鏡，若已有設備則成本可忽略）。
試劑成本：低（培養基、染色劑）。
人工成本：高（需定期觀察、染色，耗時2-4周）。
檢測時間：長（2-4周）。
通量：低（適合小樣本）。
單樣本成本：中等偏高（因時間長、重復檢測可能增加總成本）。
適用場景：科研或小規模檢測，但效率低。

2. PCR法（含qPCR）
設備成本：高（PCR儀約10,000−10,000−50,000，qPCR儀更貴）。
試劑成本：高（引物、酶、探針，單次約10−10−30）。
人工成本：低（自動化操作，耗時2-4小時）。
檢測時間：短（幾小時）。
通量：高（可批量處理，96孔板等）。
單樣本成本：中高。
適用場景：臨床或大規模檢測，靈敏度高，適合快速結果需求。

3. ELISA法
設備成本：中等（酶標儀約5,000−5,000−15,000，洗板機另計）。
試劑成本：中等（抗體、底物，單次約5−5−15）。
人工成本：中等（需手工加樣、洗板，耗時4-8小時）。
檢測時間：中等（半天至1天）。
通量：中高（適合批量樣本）。
單樣本成本：中等。
適用場景：常規檢測，檢測種類單一，適合檢測某一種或某一類支原體，平衡成本與效率。

4. 熒光染色法（如Hoechst染色）
設備成本：高（熒光顯微鏡約20,000−20,000−50,000）
試劑成本：低。
人工成本：高（需經驗判讀，耗時2-4小時）。
檢測時間：短（幾小時）。
通量：低（依賴人工分析）。
單樣本成本：低（設備投入高）。
適用場景：已有熒光顯微鏡的實驗室，小樣本快速篩查。

5. 等溫擴增法（如LAMP）
設備成本：低（僅需恒溫設備，約1,000−1,000−5,000）。
試劑成本：中等。
人工成本：低（操作簡單，耗時1-2小時）。
檢測時間：短（1-2小時）。
通量：中高（可批量處理）。
單樣本成本：中等。
適用場景：資源有限環境，科研研發使用。

綜合對比表

方法	設備成本	試劑成本	人工成本	檢測時間	通量	靈敏度
培養法	低	低	高	2-4周	低	高
PCR/qPCR	高	高	低	幾小時	高	高
ELISA	中	中	中	半天	中高	中高
熒光染色	高	低	高	幾小時	低	低
LAMP	低	中	低	1-2小時	中高	低

實際選擇需結合實驗室設備、樣本量、時間要求及預算。