高通量測序服務(wù)——真菌基因組測序

真菌屬于較低等的真核生物，種類繁多，在自然界中分布廣泛。合理利用有益真菌，控制和預(yù)防有害真菌對(duì)人類的生產(chǎn)和生活具有重要的意義。

服務(wù)類別：	測序/合成	總訪問：	2300
最后更新：	2015-7-14	半年訪問：	37
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服務(wù)商：上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司

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公司簡介

高通量測序服務(wù)——真菌基因組測序

詳細(xì)描述：

真菌屬于較低等的真核生物，種類繁多，在自然界中分布廣泛。據(jù)估計(jì)，全世界約有150萬種真菌，其中包含許多具有重要的藥用價(jià)值和食用價(jià)值的有益真菌，同時(shí)也存在著大量能引發(fā)動(dòng)植物病害的致病菌。因此，合理利用有益真菌，控制和預(yù)防有害真菌對(duì)人類的生產(chǎn)和生活具有重要的意義。而真菌基因組的闡明，將為真菌特性的分析提供有用的依據(jù)。隨著第二代高通量測序技術(shù)的成熟，基因組測序成本已大大降低，使得快速而經(jīng)濟(jì)的進(jìn)行真菌基因組測序成為可能，目前真菌基因組學(xué)研究已經(jīng)進(jìn)入了一個(gè)快速增長時(shí)期。

美吉優(yōu)勢

1. 擁有標(biāo)準(zhǔn)化操作實(shí)驗(yàn)室和高通量測序技術(shù)平臺(tái)，可以根據(jù)合作伙伴要求靈活安排實(shí)驗(yàn)，實(shí)驗(yàn)周期短，質(zhì)量可靠。

2. 擁有Roche 454和Illumina Solexa兩種高通量測序平臺(tái)，合作伙伴可根據(jù)具體需求進(jìn)行選擇，以獲取最佳的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。

3. 技術(shù)人員經(jīng)驗(yàn)豐富，可以根據(jù)合作伙伴要求在第一時(shí)間提供實(shí)驗(yàn)方案、解決實(shí)驗(yàn)問題、分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果。

4. 擁有專業(yè)的生物信息團(tuán)隊(duì)和大型計(jì)算機(jī)，可以為合作伙伴提供個(gè)性化的生物信息分析服務(wù)。

生物信息分析

1. De novo真菌基因組測序

1）基因組序列拼接

原始數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)、基因組覆蓋度計(jì)算、組裝結(jié)果統(tǒng)計(jì)等。

2）基因注釋

編碼基因預(yù)測，基因功能注釋（NR、Swiss-prot、Interpro等）、Non-coding RNA注釋、重復(fù)序列注釋等。

3）基因功能分類

GO分類、KEGG通路分析等。

4）比較基因組及進(jìn)化分析

與近源物種的基因組序列對(duì)比，進(jìn)行SNP、SV等變異結(jié)構(gòu)檢測、pan-genome和core-genome組成分析、同源基因分析、進(jìn)化分析等。

2. 真菌基因組重測序

1）原始數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)

2）短序列mapping至參考基因組

3）分析mapping區(qū)域reads的覆蓋度、重復(fù)性、覆蓋堿基的質(zhì)量及reads方向

4）SNPs、InDel、CNVs檢測

5）結(jié)構(gòu)變異（SVs）和基因組重排事件分析

上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司專注于新一代DNA高通量測序技術(shù)的應(yīng)用和推廣、生物信息分析、臨床診斷試劑盒研發(fā)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究，是上海張江高科技園區(qū)、張江藥谷重點(diǎn)支持企業(yè)，華東師范大學(xué)戰(zhàn)略合作單位。目前，美吉生物在上海、北京、廣州三個(gè)一線城市建立了實(shí)驗(yàn)基地，銷售網(wǎng)絡(luò)遍布全國各地。

美吉生物擁有世界一流的測序平臺(tái)，在ABI3730xl常規(guī)測序平臺(tái)的基礎(chǔ)上，先后引進(jìn)了羅氏454高通量測序平臺(tái)和Illumina高通量測序平臺(tái)，專業(yè)提供動(dòng)植物基因組測序、微生物基因組測序、宏基因組測序、轉(zhuǎn)錄組測序、小RNA測序、基因表達(dá)譜分析等技術(shù)服務(wù)。

美吉生物擁有一支實(shí)力雄厚的技術(shù)團(tuán)隊(duì)，有從事分子生物學(xué)研究十多年、經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)骨干，也有創(chuàng)新進(jìn)取、拼勁十足的希望之星。技術(shù)團(tuán)隊(duì)經(jīng)驗(yàn)豐富，曾參與水稻、番茄、家蠶等多項(xiàng)大型基因組學(xué)項(xiàng)目，可以為您提供專業(yè)、合理、高性價(jià)比的實(shí)驗(yàn)方案。

生物信息學(xué)是國際前沿的新興學(xué)科，近年來發(fā)展迅猛。美吉生物擁有一支具有國際一流水平的生物信息分析團(tuán)隊(duì)，不僅可以提供標(biāo)準(zhǔn)流程化的生物信息分析，還可以根據(jù)不同的課題需求，提供個(gè)性化的深度數(shù)據(jù)挖掘。

B2B(Bench to Bedside)的轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)模式，大大縮短了醫(yī)學(xué)科學(xué)從基礎(chǔ)研究到臨床應(yīng)用的時(shí)間，加速了人類進(jìn)入基因組醫(yī)學(xué)時(shí)代的步伐。基于對(duì)未來醫(yī)學(xué)發(fā)展趨勢的充分理解，美吉生物和國內(nèi)多家著名三甲醫(yī)院聯(lián)合建立了轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心，開展轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究，以迎接基因組醫(yī)學(xué)時(shí)代的到來。

美吉生物秉承“專業(yè)、卓越”的企業(yè)理念，“以客戶為本，讓客戶滿意”的服務(wù)宗旨，一如既往地致力于提供高品質(zhì)、高效率的技術(shù)服務(wù)，努力將公司打造成為國內(nèi)一流企業(yè)。因?yàn)榫礃I(yè)，所以專業(yè)；因?yàn)閷I(yè)，所以選擇；選擇美吉，選擇滿意！

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