高通量測(cè)序服務(wù)——轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
詳細(xì)描述:
轉(zhuǎn)錄組即某個(gè)物種或特定細(xì)胞在某一功能狀態(tài)下產(chǎn)生的所有RNA的總和,是研究細(xì)胞表型和功能的一個(gè)重要手段。與基因組不同的是,轉(zhuǎn)錄組的定義中包含了時(shí)間和空間的限定。同一細(xì)胞在不同的生長時(shí)期及生長環(huán)境下,其基因表達(dá)情況是不完全相同的。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-Seq)是指利用第二代高通量測(cè)序技術(shù)進(jìn)行cDNA測(cè)序,全面快速地獲取某一物種特定器官或組織在某一狀態(tài)下的幾乎所有轉(zhuǎn)錄本。相對(duì)于傳統(tǒng)芯片而言,RNA-Seq無需預(yù)先設(shè)計(jì)探針,即可對(duì)任意物種的任意細(xì)胞類型的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行檢測(cè),能夠提供更精確的數(shù)字化信號(hào),更高的檢測(cè)通量以及更廣泛的檢測(cè)范圍,是目前深入研究轉(zhuǎn)錄組復(fù)雜性的強(qiáng)大工具。
美吉優(yōu)勢(shì)
1. 擁有標(biāo)準(zhǔn)化操作實(shí)驗(yàn)室和高通量測(cè)序技術(shù)平臺(tái),可以根據(jù)合作伙伴要求靈活安排實(shí)驗(yàn),實(shí)驗(yàn)周期短,質(zhì)量可靠。
2. 擁有Roche 454和Illumina Solexa兩種高通量測(cè)序平臺(tái),合作伙伴可根據(jù)具體需求進(jìn)行選擇,以獲取最佳的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
3. 技術(shù)人員經(jīng)驗(yàn)豐富,可以根據(jù)合作伙伴要求在第一時(shí)間提供實(shí)驗(yàn)方案、解決實(shí)驗(yàn)問題、分析實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
4. 擁有專業(yè)的生物信息團(tuán)隊(duì)和大型計(jì)算機(jī),可以為合作伙伴提供個(gè)性化的生物信息分析服務(wù)。
生物信息分析
1. 有參考基因組的轉(zhuǎn)錄組分析(Transcriptome analysis with reference genome)
1)測(cè)序原始數(shù)據(jù)處理(質(zhì)量剪切、污染序列去除等)
2)Contig和Unigene統(tǒng)計(jì)分析
3)Unigene功能注釋(NR、GO 和KEGG等)
4)SNPs及SSR分析等
5)基因表達(dá)差異分析(不少于兩個(gè)樣品)
2. 無參考基因組轉(zhuǎn)錄組分析 (De novo Transcriptome Analysis)
1)測(cè)序原始數(shù)據(jù)處理(質(zhì)量剪切、污染序列去除等)
2)短序列mapping至參考基因組序列
3)基因功能注釋
4)基因結(jié)構(gòu)分析
5)可變剪切分析
6)基因表達(dá)差異分析(不少于兩個(gè)樣品)
7)預(yù)測(cè)新的基因
成功案例
美吉生物已成功完成包括線蟲、牡蠣、對(duì)蝦、蜜蜂、鯽魚、鯉魚、雞、豬、油菜花、菊花、桃樹等多個(gè)物種的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析。
最新發(fā)表文章
Nie QH, Fang MX, Jia XZ, et al. Analysis of muscle and ovary transcriptome of Sus scrofa: assembly, annotation and marker discovery. DNA Res, 2011, published on line.
bio-equip.com
上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司專注于新一代DNA高通量測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用和推廣、生物信息分析、臨床診斷試劑盒研發(fā)和轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究,是上海張江高科技園區(qū)、張江藥谷重點(diǎn)支持企業(yè),華東師范大學(xué)戰(zhàn)略合作單位。目前,美吉生物在上海、北京、廣州三個(gè)一線城市建立了實(shí)驗(yàn)基地,銷售網(wǎng)絡(luò)遍布全國各地。
美吉生物擁有世界一流的測(cè)序平臺(tái),在ABI3730xl常規(guī)測(cè)序平臺(tái)的基礎(chǔ)上,先后引進(jìn)了羅氏454高通量測(cè)序平臺(tái)和Illumina高通量測(cè)序平臺(tái),專業(yè)提供動(dòng)植物基因組測(cè)序、微生物基因組測(cè)序、宏基因組測(cè)序、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、小RNA測(cè)序、基因表達(dá)譜分析等技術(shù)服務(wù)。
美吉生物擁有一支實(shí)力雄厚的技術(shù)團(tuán)隊(duì),有從事分子生物學(xué)研究十多年、經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)骨干,也有創(chuàng)新進(jìn)取、拼勁十足的希望之星。技術(shù)團(tuán)隊(duì)經(jīng)驗(yàn)豐富,曾參與水稻、番茄、家蠶等多項(xiàng)大型基因組學(xué)項(xiàng)目,可以為您提供專業(yè)、合理、高性價(jià)比的實(shí)驗(yàn)方案。
生物信息學(xué)是國際前沿的新興學(xué)科,近年來發(fā)展迅猛。美吉生物擁有一支具有國際一流水平的生物信息分析團(tuán)隊(duì),不僅可以提供標(biāo)準(zhǔn)流程化的生物信息分析,還可以根據(jù)不同的課題需求,提供個(gè)性化的深度數(shù)據(jù)挖掘。
B2B(Bench to Bedside)的轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)模式,大大縮短了醫(yī)學(xué)科學(xué)從基礎(chǔ)研究到臨床應(yīng)用的時(shí)間,加速了人類進(jìn)入基因組醫(yī)學(xué)時(shí)代的步伐。基于對(duì)未來醫(yī)學(xué)發(fā)展趨勢(shì)的充分理解,美吉生物和國內(nèi)多家著名三甲醫(yī)院聯(lián)合建立了轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心,開展轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究,以迎接基因組醫(yī)學(xué)時(shí)代的到來。
美吉生物秉承“專業(yè)、卓越”的企業(yè)理念,“以客戶為本,讓客戶滿意”的服務(wù)宗旨,一如既往地致力于提供高品質(zhì)、高效率的技術(shù)服務(wù),努力將公司打造成為國內(nèi)一流企業(yè)。因?yàn)榫礃I(yè),所以專業(yè);因?yàn)閷I(yè),所以選擇;選擇美吉,選擇滿意!