DNA羥甲基化測序/甲基化測序服務(wù)

一、DNA羥甲基化測序服務(wù)

     DNA羥甲基化是一種重要的表觀遺傳修飾，對基因的表達起調(diào)控作用，在神經(jīng)分化和癌癥中發(fā)揮重要的作用。為深入了解5hmC的作用，我們就必須清楚5hmC在基因組的分布情況。然而，傳統(tǒng)的基于重亞硫酸鹽的方法無法區(qū)分5-hmC和5-mc。5-hmC單克隆抗體捕獲法是研究DNA羥基化修飾的利器，結(jié)合高通量測序技術(shù)以及生物信息分析，可以獲得全基因組羥甲基化分布圖，從而能幫助我們從一個新的角度來解析胚胎發(fā)育，神經(jīng)細胞分化以及癌癥發(fā)生的分子機制。
 

DNA羥甲基化測序技術(shù)優(yōu)勢

*  特異性檢測羥甲基化： 5-hmC抗體能夠區(qū)分甲基化和羥甲基化信號，特異性的檢測羥甲基化區(qū)域。

*  靈活度高：能夠直接對任意物種的高羥甲基化片段進行測序，無需已知的基因組序列信息。

*  檢測范圍廣：覆蓋整個基因組范圍的羥甲基化區(qū)域。

*  精確度高：能夠在實際結(jié)合位點50個堿基范圍內(nèi)精確定位。

*  數(shù)字化信號：直接對羥甲基化片段進行測序和定量，不存在傳統(tǒng)芯片雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應(yīng)和背景噪音問題。

康成生物提供的DNA羥甲基化測序服務(wù)流程
1.  羥甲基化DNA免疫共沉淀（hMeDIP） 
2.  測序文庫構(gòu)建
3.  DNA成簇（Cluster）擴增
4.  高通量測序
5.  數(shù)據(jù)分析
6.  提供實驗報告

康成hMeDIP-seq技術(shù)服務(wù)優(yōu)勢

*  hMeDIP富集效果特異性佳：hMeDIP是獲得準確測序數(shù)據(jù)的關(guān)鍵。康成hMeDIP平臺經(jīng)過不斷地優(yōu)化，抗體富集效率高和特異性好。

*  嚴格的質(zhì)控體系：康成生物在hMeDIP-seq每個關(guān)鍵步驟都加入了 質(zhì)控實驗（圖2，3）。這些QC數(shù)據(jù)能夠評估每個步驟的質(zhì)量。如果達不到標準，我們會重復(fù)實驗步驟或者優(yōu)化實驗體系，使得每個樣品都能夠順利進入下個實驗環(huán)節(jié)。

圖2. hMeDIP-seq技術(shù)服務(wù)流程和關(guān)鍵步驟的質(zhì)量控制

圖3. hMeDIP-qPCR 質(zhì)控。hMeDIP特異地富集羥甲基化的Spike-in序列，且陽性信號遠高于背景噪音。

*  優(yōu)化的文庫制備流程: 起始量少至1μg乃至更少量的起始DNA樣品即可進行羥甲基化測序?qū)嶒灒煌瑫r，對hMeDIP富集過程及測序文庫嚴格的質(zhì)量監(jiān)控保證了高品質(zhì)的測序結(jié)果。

*  對DNA羥甲基化水平進行數(shù)字化定量分析：通過對測序得到的大量序列進行深入分析，hMeDIP-seq得到的序列信息能夠轉(zhuǎn)換為可定量的羥甲基化水平信息。對基因組任意區(qū)域的羥甲基化水平給出定量的結(jié)果，并分析差異羥甲基化的區(qū)域。

*  可視化分析: 提供50bp精度的全基因組DNA羥甲基化信號可視化數(shù)據(jù)。通過UCSC基因組瀏覽器（UCSC genome browser），任意區(qū)域的羥甲基化水平能夠直觀的進行展示和比較。
 

二、DNA甲基化測序服務(wù)

       DNA甲基化是表觀遺傳（Epigenetics）調(diào)控的重要組成部分，在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發(fā)育以及人類腫瘤發(fā)生中起著重要的作用，是目前新的研究熱點之一。在哺乳動物中，甲基化一般發(fā)生在CpG的胞嘧啶5位碳原子上，通過使用5’-甲基胞嘧啶抗體富集高甲基化的DNA片段，并結(jié)合Illumina高通量測序平臺，對所有富集的DNA片段進行高通量測序，研究人員能夠獲得全基因組范圍內(nèi)高精度的甲基化狀態(tài)，為深入的表觀遺傳調(diào)控分析提供了更有利的切入點。
 

DNA甲基化測序技術(shù)優(yōu)勢 
* 靈活度高：能夠直接對任意物種的高甲基化片段進行測序，無需已知的基因組序列信息。

* 檢測范圍廣：覆蓋整個基因組范圍的甲基化區(qū)域。

* 精確度高：能夠在實際結(jié)合位點50個堿基范圍內(nèi)精確定位。

* 數(shù)字化信號：直接對甲基化片段進行測序和定量，不存在傳統(tǒng)芯片雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應(yīng)和背景噪音問題。

康成MeDIP-seq技術(shù)服務(wù)優(yōu)勢
＊MeDIP富集效果特異性佳：MeDIP是獲得準確測序數(shù)據(jù)的關(guān)鍵。康成MeDIP平臺經(jīng)過不斷地優(yōu)化，抗體富集效率高和特異性好。

＊嚴格的質(zhì)控體系：康成生物在MeDIP-seq每個關(guān)鍵步驟都加入了質(zhì)控實驗。這些QC數(shù)據(jù)能夠評估每個步驟的質(zhì)量。如果達不到標準，我們會重復(fù)實驗步驟或者優(yōu)化實驗體系，使得每個樣品都能夠順利進入下個實驗環(huán)節(jié)。

*圖釋： MeDIP-seq技術(shù)服務(wù)流程和關(guān)鍵步驟的質(zhì)量控制

＊優(yōu)化的文庫制備流程: 起始量少至1μg乃至更少量的起始DNA樣品即可進行甲基化測序?qū)嶒灒煌瑫r，對MeDIP富集過程及測序文庫嚴格的質(zhì)量監(jiān)控保證了高品質(zhì)的測序結(jié)果。

＊對DNA甲基化水平進行數(shù)字化定量分析：通過對測序得到的大量序列進行深入分析，MeDIP-seq得到的序列信息能夠轉(zhuǎn)換為可定量的甲基化水平信息。對基因組任意區(qū)域的甲基化水平給出定量的結(jié)果，并分析差異甲基化的區(qū)域。

＊可視化分析: 提供50bp精度的全基因組DNA甲基化信號可視化數(shù)據(jù)。通過UCSC基因組瀏覽器（UCSC genome browser），任意區(qū)域的甲基化水平能夠直觀的進行展示和比較。

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