TMT (iTRAQ) 最高可同時(shí)標(biāo)記10 (8) 組不同的生物樣品,且一次性完成全部樣品的定性定量分析,顯著的提高了實(shí)驗(yàn)通量,降低了定量誤差,可發(fā)現(xiàn)更細(xì)微的生物學(xué)差異。
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TMT標(biāo)記定量技術(shù)
Thermo ScientificTM公司的TMT (Tandem Mass Tag) 標(biāo)記定量技術(shù)和AB SCIEXTM公司的iTRAQ技術(shù)都屬于二級(jí)報(bào)告離子定量技術(shù),具有相似的原理(圖1):提取樣品中的總蛋白并酶解為多肽,多肽N-term以及末端Lysine側(cè)鏈基團(tuán)的游離氨基能夠與TMT標(biāo)簽進(jìn)行共價(jià)結(jié)合,從而使每條多肽都帶上至少一個(gè)TMT標(biāo)簽;不同TMT標(biāo)簽具有相同的分子量,但是卻有不同的同位素分布,來(lái)自不同樣品的相同多肽在MS1中同時(shí)被分離,經(jīng)裂解后在MS2中釋放出reporter,代表該多肽在對(duì)應(yīng)樣品中的相對(duì)含量。 TMT (iTRAQ) 最高可同時(shí)標(biāo)記10 (8) 組不同的生物樣品,且一次性完成全部樣品的定性定量分析,顯著的提高了實(shí)驗(yàn)通量,降低了定量誤差,可發(fā)現(xiàn)更細(xì)微的生物學(xué)差異。
圖1. TMT標(biāo)簽結(jié)構(gòu)和定量原理。
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
• 通量與深度的完美結(jié)合:在質(zhì)譜本身高通量的基礎(chǔ)上,TMT技術(shù)又進(jìn)一步擴(kuò)大了這種優(yōu)勢(shì),相比SILAC、Dimethyl等標(biāo)記定量技術(shù),TMT可同時(shí)完成多至10個(gè)不同樣品的定量分析;運(yùn)用high pH反相HPLC分級(jí)為8個(gè)組分,每個(gè)組分再經(jīng)low pH反相HPLC分離,兩次正交液相分離,顯著的提高了鑒定和定量深度。
• 特異性與靈敏度兼?zhèn)洌夯谫|(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)精確到單個(gè)氨基酸位點(diǎn),蛋白鑒定準(zhǔn)確,靈敏度高,是profiling分析和PTM研究的強(qiáng)大工具。
• 嚴(yán)格的質(zhì)量控制:數(shù)據(jù)穩(wěn)定、重現(xiàn)性好,定量動(dòng)態(tài)范圍廣,多個(gè)樣品平行處理極大的降低了實(shí)驗(yàn)誤差。
• 專業(yè)的數(shù)據(jù)分析:標(biāo)準(zhǔn)的搜庫(kù)流程,專業(yè)的統(tǒng)計(jì)和生信分析,出版級(jí)的圖表展示,完整全面的分析報(bào)告。
樣品要求
樣品類型 |
樣品要求 |
蛋白質(zhì)提取物 |
濃度 >1μg/μl,蛋白質(zhì)總量 >200μg |
細(xì)胞樣品 |
細(xì)胞量 >5×106 |
組織樣品 |
動(dòng)物、微生物組織濕重 >100mg |
體液樣品 |
血液體積 >500μl,血清、血漿、腦脊液 >500μl,尿液 >50ml |
應(yīng)用領(lǐng)域
• 疾病標(biāo)志物篩選
• 分子機(jī)制研究
• 藥物作用靶點(diǎn)研究
• 特殊功能蛋白質(zhì)篩選
儀器平臺(tái)
Thermo Scientific EASY-nLC 1200
Thermo Scientific Q Exactive
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