SWATH（Sequential Window Acquisition of all THeoretical Mass Spectra）是瑞士蘇黎世聯(lián)邦理工學(xué)院的Ruedi Aebersold 博士及其團(tuán)隊與AB-SCIEX聯(lián)合推出的一項全新的質(zhì)譜技術(shù)。SWATH采集模式是一種新型的MS/MS 掃描技術(shù)，它將掃描范圍劃分為以25 Dalton 為間隔的一系列區(qū)間，通過超高速掃描來獲得掃描范圍內(nèi)全部離子的所有碎片信息，是 MS/MSALL技術(shù)的擴(kuò)展。SWATH技術(shù)是一種真正全景式的、高通量的質(zhì)譜技術(shù)，同時也大大提高了定量的可重現(xiàn)性。

  金開瑞現(xiàn)有的Triple-TOF 5600-plus質(zhì)譜系統(tǒng)，使SWATH定量具有較高的準(zhǔn)確度和動態(tài)范圍，可檢測到蛋白質(zhì)的豐度差異極大，跨越4個數(shù)量級。且SWATH方法的靈敏度和動態(tài)范圍與SRM分析水平相當(dāng)。

  經(jīng)過多年的研發(fā)，金開瑞已成功開發(fā)SWATH定量與分析技術(shù)，現(xiàn)為國內(nèi)首家推出SWATH技術(shù)服務(wù)的公司！

一、服務(wù)特色

技術(shù)特點(diǎn)

1、靈敏度高：SWATH技術(shù)繼承了MRM的數(shù)據(jù)采集模式，結(jié)合高分辨率的AB sciex Triple TOF-plus，具有與MRM相當(dāng)?shù)撵`敏度；

2、可重現(xiàn)性高：重復(fù)樣品間的定量相關(guān)性可達(dá)到0.99以上；

3、定量準(zhǔn)確度高：定量準(zhǔn)確度幾乎與MRM技術(shù)相當(dāng)；

4、線性動態(tài)范圍廣：定量范圍可跨越4個數(shù)量級；

5、通量大：一次實(shí)驗可檢測到2000種以上蛋白并定量。

適用范圍

物種具有基因組序列、ESTs序列或蛋白質(zhì)參考序列

檢測細(xì)菌等復(fù)雜度較低的樣品

可以和MRMHR技術(shù)聯(lián)合使用發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)志物

可以和TAP技術(shù)聯(lián)合使用鑒定相互作用蛋白

二、服務(wù)說明

服務(wù)流程

接受訂單及樣品——蛋白提取——蛋白質(zhì)定量——還原烷基化、酶切——除鹽、抽干——HPLC分離——LC-MS/MS DDA模式質(zhì)譜檢測——LC-SWATH模式質(zhì)譜檢測——生物信息分析——結(jié)果交付

客戶提供

需鑒定的樣品；

樣品信息單，需詳細(xì)填寫樣品來源、含量、狀態(tài)及其他基本信息。

最終交付

實(shí)驗報告一份，含具體實(shí)驗流程及蛋白質(zhì)組鑒定及定量結(jié)果（生物信息學(xué)分析）。

生物信息學(xué)分析內(nèi)容包括：

SWATH 參考譜圖數(shù)據(jù)庫構(gòu)建：通過DDA模式的掃描結(jié)果，譜圖數(shù)據(jù)庫構(gòu)建、全譜鑒定及結(jié)果可靠性評估

SWATH定量：根據(jù)二級碎片離子的全掃描結(jié)果實(shí)現(xiàn)二級離子的定量；SWATH結(jié)果可靠性分析；差異表達(dá)分析；層次聚類；PCA分析等。

蛋白質(zhì)功能注釋：包括GO注釋、COG分類和KEGG Pathway分析

差異蛋白功能富集：包括GO富集、Pathway富集

差異蛋白網(wǎng)絡(luò)互作：基于STRING 數(shù)據(jù)庫的PPI分析，基于Cytoscape的可視化展示

三、服務(wù)周期及報價

服務(wù)周期

自送樣起45個工作日。

服務(wù)報價

請詢價。

如您對swath定量感興趣或者需要技術(shù)支持，請您與我聯(lián)系QQ：3013422302，或者瀏覽我們公司的網(wǎng)站http://www.genecreate.cn/，可以搜索到您想要的服務(wù)信息，武漢金開瑞生物有限公司期待和您的合作。