百泰派克公司采用Q ExactiveHF質譜平臺,Orbitrap Fusion質譜平臺,Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,推出基于SILAC的定量蛋白組分析服務
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服務商: 北京百泰派克生物科技有限公司 | 查看該公司所有服務 >> |
SILAC即細胞培養條件下穩定同位素標記技術(Stable Isotope Labeling By Amino Acids In Cell Culture,SILAC),其實驗流程是在細胞培養基中加入輕、中或重型穩定同位素標記的必需氨基酸(賴氨酸和精氨酸),通過細胞的正常代謝,使新合成的蛋白帶上穩定同位素標簽。等量混合各類型蛋白質,酶解后進行質譜分析。通過比較一級質譜圖中同位素峰型的面積大小進行相對定量,同時二級譜圖對肽段進行序列測定從而進行蛋白鑒定。
百泰派克公司采用Thermo Fisher的Q ExactiveHF質譜平臺,Orbitrap Fusion質譜平臺,Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC,推出基于SILAC的定量蛋白組分析服務技術包裹,您只需要將您的實驗目的告訴我們并將您的細胞寄給我們,我們會負責項目后續所有事宜,包括細胞培養、細胞標記、蛋白提取、蛋白酶切、肽段分離、質譜分析、質譜原始數據分析、生物信息學分析。
1.您只需干冰將凍存細胞寄給我們即可,同時保證細胞具有可以傳代培養5次以上的能力;
2.如果您需要自己標記細胞并完成細胞的刺激等處理過程,您只需要將標記完成并且經過處理的細胞樣品或者蛋白樣品干冰寄給我們即可;對于每個樣品,需要保證含有50-100ug蛋白。
您只需下單-寄送樣品
百泰派克一站式服務完成:樣品處理-上機分析-數據分析-項目報告
對于動物細胞來說有必需氨基酸和非必須氨基酸之分,必須氨基酸是指細胞自身無法合成,只能從體外獲取。SILAC定量技術就是利用這一原理,將細胞培養體系中的兩種必須氨基酸:賴氨酸和精氨酸(選擇此兩種氨基酸的目的是因為后續的酶切反應會使用Trypsin進行,該酶的切割位點是賴氨酸或者精氨酸后的肽鍵,選擇此兩種氨基酸對蛋白進行標記,保證酶切之后的每一個肽段均會帶有標記)替換成穩定同位素標記的"重標"賴氨酸和精氨酸,經過細胞傳代培養,"重標"氨基酸會逐步替換掉原來的"輕標"氨基酸,之前的實驗表明,細胞傳代培養5此以上,上述替換過程可以基本完成。經過標記的"重標"細胞蛋白與"輕標"細胞蛋白有同樣的氨基酸序列,但是分子量有明顯并且固定的差異,保證"重標"和"輕標"肽段在質譜分析過程中可以同時被鑒定到并且形成匹配關系,通過直接比較兩者質譜峰的面積得到兩個肽段所代表的蛋白的相對定量關系。
基于SILAC的定量蛋白組研究路線
在最終的技術報告中,百泰會為您提供詳細的中英文雙語版技術報告,報告包括:
1, 實驗步驟(中英文)
2, 相關的質譜參數(中英文)
3, 鑒定物質的信息
4, 原始數據
5, 生物信息學分析