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單細(xì)胞基因組測(cè)序
通過對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行基因組擴(kuò)增和測(cè)序,解決了用組織樣本無法獲得不同單個(gè)細(xì)胞的異質(zhì)性信息、樣本量太少無法進(jìn)行常規(guī)測(cè)序的難題
服務(wù)類別:測(cè)序/合成總訪問:1060
最后更新:2020-10-16半年訪問:92
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 先進(jìn)的技術(shù),大有用武之地

單細(xì)胞測(cè)序通過對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行基因組擴(kuò)增和測(cè)序,解決了用組織樣本無法獲得不同單個(gè)細(xì)胞的異質(zhì)性信息、樣本量太少無法進(jìn)行常規(guī)測(cè)序的難題,為科學(xué)家研究解析單個(gè)細(xì)胞的行為、機(jī)制、與機(jī)體的關(guān)系等提供了新方向,為早期檢測(cè)、診斷疾病及疾病的個(gè)體化治療提供指導(dǎo)。

科學(xué)方案設(shè)計(jì)

從材料選取,建庫測(cè)序,到數(shù)據(jù)分析,每一步都需要科學(xué)、縝密的設(shè)計(jì),以保障高質(zhì)量研究成果。

信息分析

單細(xì)胞測(cè)序可針對(duì)性揭示單個(gè)細(xì)胞整體水平的基因信息,解決了細(xì)胞異質(zhì)性難題。
可最真實(shí)的獲得單克隆細(xì)胞的具體突變來源及精準(zhǔn)的突變頻率,用來研究疾病以及癌癥發(fā)生發(fā)展機(jī)制等。

Single cell 全基因組/外顯子組測(cè)序
癌癥基因組學(xué) 疾病基因組學(xué)
標(biāo)準(zhǔn)信息分析A 標(biāo)準(zhǔn)信息分析A+ 標(biāo)準(zhǔn)信息分析Pro

去除接頭污染序列及低質(zhì)量數(shù)
據(jù)比對(duì),產(chǎn)出數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)SNP檢
測(cè)、注釋和統(tǒng)計(jì)InDel檢測(cè)、注
釋和統(tǒng)計(jì)CNV檢測(cè)、注釋和統(tǒng)
計(jì)(僅全基因組測(cè)序)SV檢
測(cè)、注釋和統(tǒng)計(jì)(僅全基因組
測(cè)序)

1. 數(shù)據(jù)質(zhì)控:去除接頭污染和
低質(zhì)量數(shù)據(jù)
2. 與參考序列進(jìn)行比對(duì)、統(tǒng)計(jì)
測(cè)序深度及覆蓋度
3. Somatic SNV/InDel/CNV/SV檢測(cè)、注釋及統(tǒng)計(jì)(腫瘤成
對(duì)樣本)

1. 數(shù)據(jù)質(zhì)控:去除接頭污染和低質(zhì)量
數(shù)據(jù)
2. 與參考序列進(jìn)行比對(duì)、統(tǒng)計(jì)測(cè)序深
度及覆蓋度
3. Somatic SNV/InDel/CNV/SV檢
測(cè)、注釋及統(tǒng)計(jì)(腫瘤成對(duì)樣本)
4. 單細(xì)胞Germline SNP聚類分析
5. PAC(主成分)分析
6. Heatmap展示圖(somatic
SNV)
7. 高頻突變分析(>2對(duì)樣本)
  7.1高頻突變基因統(tǒng)計(jì)
  7.2高頻突變基因富集分析
8. NMF突變特征/突變頻譜分析
  8.1突變頻譜分析
  8.2NMF突變特征分析(>2對(duì)樣
本)
9. NovoDriver已知驅(qū)動(dòng)基因篩選
10. 基因組變異Circos圖展示

1. 樣本間協(xié)同性分析(腫瘤單細(xì)胞樣
本數(shù)量≥2,且必須有組織樣本)
2. MRT高頻突變基因相關(guān)性分析(>
2對(duì)樣本)
  2.1高頻突變基因協(xié)同作用分析
  2.2高頻突變基因互斥作用分析
3. OncodriveCLUST驅(qū)動(dòng)基因預(yù)測(cè)
(>2對(duì)樣本)
4. 突變位點(diǎn)分布情況分析
  4.1高頻突變基因SNV/InDel突變
位點(diǎn)展示
  4.2預(yù)測(cè)驅(qū)動(dòng)基因SNV/InDel突變
位點(diǎn)展示
5. 高頻CNV分析
  5.1 CNV分布分析
  5.2 CNV重現(xiàn)性分析(>2對(duì)樣
本)
6. 雜合性缺失(LOH)分析
7. LOF蛋白功能缺失分析
8. NovoDrug高頻突變基因靶向用藥
預(yù)測(cè)
9. NovoDR耐藥突變篩選
10. NovoNoncoding非編碼區(qū)高頻
突變分析(單細(xì)胞外顯子測(cè)序僅不包
括此分析)

* 定制化信息分析,可結(jié)合客戶的需求,協(xié)商確定定制化信息分析內(nèi)容
悅讀高質(zhì)量測(cè)序數(shù)據(jù),盡享HPC澎湃動(dòng)力

基因組測(cè)序采用先進(jìn)的Illumina測(cè)序平臺(tái),快速、高效地讀取高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)。
諾禾致源高性能計(jì)算平臺(tái)(High Performance Computing,HPC)采用DELL計(jì)算節(jié)點(diǎn)和Isilon存儲(chǔ)的高效組合,實(shí)現(xiàn)快速穩(wěn)定的測(cè)序數(shù)據(jù)分析及交付。隨著公司業(yè)務(wù)的發(fā)展,高性能計(jì)算平臺(tái)將會(huì)持續(xù)更新并擴(kuò)容,以保證高效的數(shù)據(jù)處理和安全的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)。

出色完成每一個(gè)項(xiàng)目環(huán)節(jié),助力科學(xué)研究

采用國際認(rèn)可的全基因組擴(kuò)增技術(shù)

多次退火環(huán)狀循環(huán)擴(kuò)增技術(shù)(Multiple annealing and looping-based amplification cycles, MALBAC),具有低偏倚性。

定制化信息分析

針對(duì)不同項(xiàng)目,除了進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)信息分析外,通過與合作伙伴共同探討,制定可行的個(gè)性化信息分析方案,整合各種主流軟件,優(yōu)化分析結(jié)果,以確保結(jié)果的準(zhǔn)確性及創(chuàng)新性。

豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)

諾禾致源已成功完成單精子全基因組測(cè)序、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序等,相關(guān)研究成果在Science、 Nature等頂級(jí)科學(xué)期刊發(fā)表。

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