自下而上蛋白組學(xué)分析策略的應(yīng)用受到選擇性剪接形式的不完全或模糊表征、多樣的翻譯后修飾和內(nèi)源性蛋白質(zhì)裂解的限制。隨著分析工具的進(jìn)步，自上而下的策略得到了更多的應(yīng)用。除了FT-ICR質(zhì)譜儀外，orbitrap質(zhì)譜儀的發(fā)明和創(chuàng)新推動(dòng)了自上而下蛋白質(zhì)組學(xué)的發(fā)展。

蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)鑒定

由于蛋白質(zhì)在分析前不需要消化，采用自上而下的策略可以保持和檢測采用鳥槍法時(shí)丟失的信息，如含二硫鍵的四級(jí)結(jié)構(gòu)，這是自上而下法在蛋白質(zhì)水平上表征二硫鍵等翻譯后修飾的獨(dú)特優(yōu)勢。也使自上而下法在如胰島素等蛋白質(zhì)治療劑QC分析重組蛋白是否正確表達(dá)、折疊和組裝中得到越來越多的應(yīng)用。

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合nanoLC-MS/MS納升色譜，提供自上而下的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)表征服務(wù)。