多肽從頭測(cè)序服務(wù)
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多肽的序列分析常見(jiàn)的有兩種方法:數(shù)據(jù)庫(kù)搜索和de novo從頭測(cè)序法。數(shù)據(jù)庫(kù)搜索需要在已知/給定的數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行搜庫(kù),從而對(duì)多肽序列進(jìn)行識(shí)別。但是由于有些物種的數(shù)據(jù)庫(kù)不足,很多新的或是活性肽無(wú)法在數(shù)據(jù)中匹配到。多肽從頭測(cè)序可以解決這個(gè)難題。多肽從頭測(cè)序是指在沒(méi)有序列數(shù)據(jù)庫(kù)的幫助下,利用串聯(lián)質(zhì)譜(MS/MS)獲取肽的氨基酸序列的分析過(guò)程。優(yōu)勢(shì)在于,無(wú)論有沒(méi)有理論數(shù)據(jù)庫(kù),抑或是新的、未知的多肽均可對(duì)其進(jìn)行序列分析。
從頭測(cè)序的基本原理是利用兩個(gè)片段離子之間的質(zhì)量差來(lái)計(jì)算肽鏈上氨基酸殘基的質(zhì)量。多肽從頭測(cè)序技術(shù)的實(shí)現(xiàn)與質(zhì)譜技術(shù)的發(fā)展緊密相關(guān)。近年來(lái)質(zhì)譜的質(zhì)量分辨率提高了好幾個(gè)數(shù)量級(jí),尤其是高精確質(zhì)譜性能的顯著提高為多肽序列分析提供了有力的基礎(chǔ)。
多肽從頭測(cè)序 高質(zhì)量光譜理論碎片離子示意圖
百泰派克生物科技使用Thermo公司最新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀結(jié)合Nano-LC納升色譜技術(shù),提供基于質(zhì)譜的多肽de novo從頭測(cè)序服務(wù),對(duì)多肽序列進(jìn)行分析。百泰派克使用Thermo公司最新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀實(shí)現(xiàn)對(duì)肽段樣品的序列分析,Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀是現(xiàn)在分辨率和靈敏度最高的質(zhì)譜儀,保證了低豐度肽段碎裂片段鑒定的靈敏度;同時(shí)在肽段碎裂過(guò)程中采取HCD與ETD結(jié)合的模式,保證肽段碎裂片段的完整性。得到質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)之后,采用從頭測(cè)序的方式對(duì)多肽序列進(jìn)行推導(dǎo)。
樣品制備的建議:
盡可能準(zhǔn)備20 ug以上的樣品,溶液和凍干粉均可。如果是溶液樣品,buffer中不含有高鹽、SDS等去垢劑。
**可咨詢百泰派克生物科技的技術(shù)人員,有針對(duì)性的進(jìn)行樣品制備。
百泰派克生物科技可對(duì)來(lái)自液體及固體狀態(tài)下的樣品進(jìn)行多肽序列分析。固體樣品,使用冰袋運(yùn)輸即可;溶液樣品,可進(jìn)行真空抽干或冷凍抽干后,使用冰袋運(yùn)輸,也可通過(guò)干冰對(duì)樣品進(jìn)行運(yùn)輸。歡迎來(lái)電咨詢。