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期盼10個月,Sanger miRBase正式發布最新20.0版miRNA數據庫(2013年6月24日)HOT!
20.0版miRNA數據庫介紹:
在20.0版數據庫中,新增成熟體miRNA在動物中最具代表性的有Homo sapiens [人]新增536條,相比于19.0版(下同),增長高達26%;Mus musculus [小鼠]新增627條,增長更是接近50%;Gallus gallus [雞]新增205條,增長超過25%。植物中增長最為突出的是Solanum tuberosum[馬鈴薯]新增332條,Populus trichocarpa [毛果楊]新增32條,Linum usitatissimum [亞麻]新增124條(亞麻為新增物種)。此外,新報道了一系列物種的miRNA序列,包括Ictalurus punctatus [斑點叉尾鮰],Branchiostoma belcheri [文昌魚],Avicennia marina [白骨壤],Prunus persica [碧桃],Duck enteritis virus [鴨腸炎病毒]*等。
靶向測序-Targeted Sequencing
充分利用下一代測序技術優勢
得益于在DNA測序技術上取得的重大進展,近期出現了多種全新的“下一代”測序平臺。這些平臺能夠十分快速并且經濟地獲取高通量的讀數(reads)。將來,科研人員將可以利用這些新技術對復雜真核生物全基因組進行常規測序。
現在,這些新技術可十分有效地用于復雜基因組特定靶區域遺傳變異的研究。通過定位特定區域,研究人員可以更好的發揮下一代測序技術的優勢。事實上,專注于您感興趣的區域,可以獲取更多的信息。
芯片序列捕獲(On Chip Sequence Capture)
LC Sciences擁有的µParaflo技術非常適合于提供序列捕獲解決方案。因為此項技術可在生物芯片上高通量并行合成高質量DNA。客戶定制的數千條寡核苷酸序列可在一個由程序控制的高密度微流體芯片上原位合成,并且利用標準的寡核苷酸合成化學和先進的微流體設計可確保探針的高質量合成。基因組樣品可直接應用于生物芯片進行靶序列捕獲。回收富集的靶序列即可用于測序。
序列捕獲服務
客戶只需提供片段化的基因組樣品。
服務包括:樣品質控,探針設計,微陣列合成,樣品雜交,序列回收,雙重PCR和最終產物質控。
獲取已通過質控,可直接用于下一代測序的最終產物。
優勢
充分利用“下一代”測序技術優勢——僅以感興趣的基因組區域為靶標,可以獲取更多信息。
以客戶指定的遺傳元件為靶標——完全按照客戶要求定制合成微陣列,滿足客戶對任意物種,任意基因組區域,鄰近或分散區域的研究需求。
消除多重PCR在時間,成本以及性能上的限制。
應用
靶向特異地篩選指定基因組區域,如疑似癌癥區域,SNP區域等。
靶向特異地篩選RNA序列,如轉錄組序列,mRNA,miRNA等。
利用微陣列上的捕獲探針進行特定序列的富集或去除,如去除干擾測序反應的序列或是高豐度的重復序列。
純化序列,可確保進行多重的,高覆蓋度以及高動態范圍的測序反應。