RNA測序技術服務

      相對于傳統的芯片雜交平臺，RNA測序無需預先針對已知序列設計探針，即可在轉錄本水平和基因水平對整體轉錄活動進行檢測。并且具有定量更準確，檢測通量更高，檢測范圍更廣等優點。此外，在分析轉錄本的結構和表達水平的同時，還能發現未知轉錄本和稀有轉錄本，精確地識別可變剪切位點以及可能的點突變，提供最全面的轉錄組信息。
 

RNA-seq技術優勢

• 數字化信號：直接測定每個轉錄本片段序列，單核苷酸分辨率的精確度，同時不存在傳統微陣列雜交的熒光模擬信號帶來的交叉反應和背景噪音問題。
• 高靈敏度：能夠檢測到細胞中少至幾個拷貝的稀有轉錄本。
• 任意物種的全基因組表達分析：無需預先設計特異性探針，因此無需了解物種基因信息，能夠直接對任何物種進行轉錄組分析。同時能夠檢測未知基因，發現新的轉錄本，并精確地識別可變剪切位點及cSNP，UTR區域。
• 更廣的檢測范圍：高于6個數量級的動態檢測范圍，能夠同時鑒定和定量稀有轉錄本和正常轉錄本。
   

康成生物RNA-seq技術服務特色

1. 采用rRNA去除方法富集，檢測更為全面

采用去rRNA的方法進行RNA富集，同時保留帶PolyA尾和不帶PolyA尾的RNA，為您的研究提供全面可靠的數據。

*圖釋：康成生物的RNA富集方案能夠有效的保留帶PolyA尾巴和不帶PolyA尾巴的轉錄本，從而為客戶提供更加全面可靠的數據。

2. 可采用降解的RNA進行實驗，特別適用于臨床樣品（如FFPE樣品）的檢測

康成生物采用的去rRNA試劑盒能夠有效的去除降解的rRNA，對功能性的RNA分子進行有效的富集， 特別適用于臨床樣品的檢測。

*圖釋：康成生物的RNA富集方案適用于降解的RNA樣品。

3. 鏈特異性文庫構建

采用的鏈特異性文庫構建方法，可以有效區分正義鏈和反義鏈，幫助您同時獲得準確的正義鏈和反義鏈RNA的表達信息。

*圖釋：康成生物采用鏈特異性的建庫方法，可以有效區分正義轉錄本和反義轉錄本。

4.均勻覆蓋轉錄本，5’和3’端偏好性低

采用基于dUTP的建庫方案，Reads均勻覆蓋轉錄本，測序結果更可靠。

*圖釋：康成生物采用基于dUTP的建庫方法，測序結果無5’和3’偏好性。

康成生物RNA-seq數據結果展示

1. 基因集富集分析 (GSEA)：利用一列（排序的）基因進行基因集富集分析，能夠揭示這些基因在不同基因集間的富集情況。

*圖釋：基因集富集分析顯示在Cell Cycle Pathway基因集中富集

2. 網絡分析：通過GO富集分析挑選感興趣的GO term，對其中的基因構建基因網絡圖。

*圖釋：GO term-基因網絡圖，綠色和藍色：特異基因；紅色：共有基因

3. RNA-Seq和ChIP-Seq整合分析：通過整合RNA-Seq結果和ChIP-Seq富集峰，能夠更直觀地了解基因啟動子區的特征。

*圖釋：啟動子區的RNA-Seq和ChIP-Seq可視化信號