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磷酸化蛋白質(zhì)組鑒定
金開瑞生物擁有分子生物學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、蛋白表達(dá)、抗體制備、試劑盒合作開發(fā)、檢測(cè)分析等六大服務(wù)平臺(tái),專業(yè)為生物技術(shù)領(lǐng)域的科研人員提供高質(zhì)量的生物技術(shù)外包服務(wù)。
服務(wù)類別:分子與細(xì)胞總訪問:1087
最后更新:2017-5-2半年訪問:64
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  蛋白質(zhì)磷酸化是生物體中最常見、最重要的一種蛋白質(zhì)翻譯后修飾方式,它可以通過激發(fā)、調(diào)節(jié)諸多信號(hào)通路進(jìn)而參與調(diào)控生物體的生長(zhǎng)、發(fā)育、逆境應(yīng)激、疾病發(fā)生等多種生命過程,所以磷酸化一直是生物學(xué)研究的重點(diǎn)與熱點(diǎn)。

  磷酸化蛋白質(zhì)組全譜鑒定以組織、細(xì)胞等較為復(fù)雜樣本為研究對(duì)象,目的在于鑒定樣品中發(fā)生磷酸化的蛋白質(zhì)以及相應(yīng)的磷酸化位點(diǎn)。首先對(duì)蛋白樣本進(jìn)行酶解,TiO2或IMAC-Fe或IMAC-Ti富集磷酸化多肽,5600-plus質(zhì)譜檢測(cè),利用得到的質(zhì)譜譜圖與相應(yīng)數(shù)據(jù)庫(kù)搜索比較,從而得到肽段序列結(jié)果,同時(shí)通過生物信息軟件計(jì)算出磷酸化位點(diǎn)。對(duì)于磷酸化位點(diǎn)鑒定,為了增加定位修飾位點(diǎn)的準(zhǔn)確性,金開瑞采用較流行的Ascore算法對(duì)發(fā)生在各位點(diǎn)的磷酸化修飾做進(jìn)一步打分評(píng)估,從而正確辨別真實(shí)修飾位點(diǎn)。

  金開瑞可您的需求,進(jìn)行根據(jù)客戶需求,提供磷酸化蛋白質(zhì)組鑒定服務(wù)

一、服務(wù)特色

技術(shù)特點(diǎn)

采用主流的TiO2 / IMAC富集方法,特異性高,富集效率好;

通過高分辨率、高掃描速度的質(zhì)譜,對(duì)富集的磷酸化肽段進(jìn)行大規(guī)模鑒定;

結(jié)合常用的定量技術(shù)可對(duì)不同樣品間的磷酸化水平的差異進(jìn)行定量比較。

 

適用范圍

已知物種基因組序列、ESTs序列或蛋白質(zhì)序列全庫(kù)

無(wú)其他特別要求

二、服務(wù)說明

 

服務(wù)流程

接受訂單及樣品——蛋白提取——肽段酶解——TiO2富集——HPLC分離——LC-MS/MS——生物信息分析——結(jié)果交付

客戶提供

需鑒定的樣品;

樣品信息單,需詳細(xì)填寫樣品來源、含量、狀態(tài)及其他基本信息。

 

最終交付

實(shí)驗(yàn)報(bào)告一份,含具體實(shí)驗(yàn)流程及蛋白質(zhì)組鑒定及定量結(jié)果(生物信息學(xué)分析)。

生物信息學(xué)分析內(nèi)容包括:

1. 修飾蛋白、修飾位點(diǎn)鑒定;

2. 鑒定結(jié)果特征分布:肽段長(zhǎng)度、蛋白覆蓋度分布、unique肽段分布;

3. 修飾位點(diǎn)motif預(yù)測(cè);

4. 蛋白質(zhì)GO功能分類、COG注釋、Pathway通路注釋;

5. 蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)互作預(yù)測(cè)(高級(jí)分析)

6. 蛋白質(zhì)Domain預(yù)測(cè)(高級(jí)分析)

7. 磷酸化蛋白激酶預(yù)測(cè)(高級(jí)分析)

 

三、服務(wù)周期及報(bào)價(jià)

服務(wù)周期

自送樣起45個(gè)工作日。

 

服務(wù)報(bào)價(jià)

請(qǐng)?jiān)儍r(jià)。

 

如對(duì)磷酸化蛋白質(zhì)組鑒定感興趣或者需要技術(shù)支持,請(qǐng)您與我聯(lián)系QQ:3013422302,或者瀏覽我們公司的網(wǎng)站http://www.genecreate.cn/,可以搜索到您想要的服務(wù)信息,武漢金開瑞生物工程有限公司期待和您的合作。

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