真核有參轉錄組測序采用Illumina測序平臺,對真核生物特定組織或細胞在某個特定狀態下轉錄的所有mRNA進行測序,與參考基因組比對,既可全面快速分析mRNA序列和豐度信息、又可對基因結構和產生的新轉錄本進行分析。
基于優質的測序平臺,通過reads與參考基因組比對,系統全面的對基因表達定量和結構分析,獲得某個物種在特定條件下的轉錄信息。
從材料選取,建庫測序,到數據分析,每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。
諾禾致源有參轉錄組測序項目信息分析,經過嚴格數據質控保證數據分析可靠性,信息分析分為表達水平分析和結構水平分析。
基因結構水平分析 | 基因表達水平分析 |
與參考基因組比對 | 基因表達水平分析 |
新轉錄本預測 | 差異基因分析 |
可變剪切分析 | GO/KEGG富集分析 |
SNP分析 | 蛋白互作網絡分析 |
InDel分析 | 轉錄因子注釋 |
真核有參轉錄組測序采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。
至2015年12月,諾禾致源已經成功對水稻、擬南芥、番茄、花生、棉花、黃瓜、人、大鼠、等150多個有參考基因組的物種進行了轉錄組測序分析,并助力研究者在Cell Stem Cell、Genome Research、Nature Communications 等權威期刊發表高水平文章多篇。
“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”,
確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。