采用Illumina測(cè)序平臺(tái),對(duì)真核生物特定組織或細(xì)胞在某個(gè)特定狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄的所有RNA進(jìn)行測(cè)序,拼接出最長的轉(zhuǎn)錄本為unigene,以u(píng)nigene為參考序列進(jìn)行后續(xù)分析
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真核無參轉(zhuǎn)錄組測(cè)序采用Illumina測(cè)序平臺(tái),對(duì)真核生物特定組織或細(xì)胞在某個(gè)特定狀態(tài)下轉(zhuǎn)錄的所有RNA進(jìn)行測(cè)序,拼接出最長的轉(zhuǎn)錄本為unigene,以u(píng)nigene為參考序列進(jìn)行后續(xù)分析,
為研究無參考基因組物種的轉(zhuǎn)錄水平變化提供有力的技術(shù)手段。
基于優(yōu)質(zhì)的測(cè)序平臺(tái),利用國際認(rèn)可的拼接軟件進(jìn)行轉(zhuǎn)錄本拼接、注釋后,全方位分析基因表達(dá)水平和結(jié)構(gòu)信息,實(shí)現(xiàn)無參物種研究內(nèi)容最大化。
從材料選取,建庫測(cè)序,到數(shù)據(jù)分析,每一步都需要科學(xué)、縝密的設(shè)計(jì),以保障高質(zhì)量研究成果。
諾禾致源無參轉(zhuǎn)錄組測(cè)序項(xiàng)目信息分析,經(jīng)過嚴(yán)格數(shù)據(jù)質(zhì)控保證數(shù)據(jù)分析可靠性,信息分析分為表達(dá)水平分析和結(jié)構(gòu)水平分析。
了解更多>>轉(zhuǎn)錄本拼接組裝 | 基因表達(dá)水平定量 |
基因功能注釋(7大數(shù)據(jù)庫) | 樣品間相關(guān)性分析 |
CDS預(yù)測(cè) | 基因差異表達(dá)分析 |
SNP分析 | 差異表達(dá)基因功能富集分析 |
SSR分析 | 差異表達(dá)基因的蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)分析 |
轉(zhuǎn)錄因子注釋 | 分析結(jié)果可視化 |
真核無參轉(zhuǎn)錄組采用先進(jìn)的Illumina測(cè)序平臺(tái),快速、高效地讀取高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù)。
諾禾致源高性能計(jì)算平臺(tái)(High Performance Computing,HPC)采用DELL計(jì)算節(jié)點(diǎn)和Isilon存儲(chǔ)的高效組合,實(shí)現(xiàn)快速穩(wěn)定的測(cè)序數(shù)據(jù)分析及交付。隨著公司業(yè)務(wù)的發(fā)展,高性能計(jì)算平臺(tái)將會(huì)持續(xù)更新并擴(kuò)容,以保證高效的數(shù)據(jù)處理和安全的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)。
至2015年12月,諾禾致源已經(jīng)成功對(duì)櫻桃、蚊子、草莓、牡蠣、鯽魚、夜蛾等300多個(gè)無參考基因組物種進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,助力研究者在Plant biotechnology journal、Scientific Reports 、BMC Genomics等著名期刊發(fā)表高水平文章。
“科學(xué)的方案設(shè)計(jì),嚴(yán)格的質(zhì)控管理,專業(yè)的分析團(tuán)隊(duì),豐富的項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),優(yōu)質(zhì)的項(xiàng)目服務(wù)”,
確保每一個(gè)環(huán)節(jié)都能出色完成,助力科學(xué)研究。