宏轉錄組(Metatranscriptome)測序是指從整體水平上研究某一特定環境,特定時期群體生命全部基因組轉錄情況以及轉錄調控規律的研究手段,它以生態環境中的全部RNA為研究對象,避開了微生物分離培養困難的問題,能有效的擴展微生物資源的利用空間。相較于宏基因組,宏轉錄組能從轉錄水平研究復雜微生物群落變化,能更好的挖掘潛在的新基因。
諾禾致源宏轉錄組研究采用先進的測序平臺,高通量覆蓋可全面檢測生態環境中的微生物信息,
充分挖掘樣品中存在的微生物多樣性及動態變化情況。具有“短周期、高通量、全分析”的優勢,已廣泛應用于腸道內容物、土壤、水體等研究中。
從材料選取,建庫測序,到數據分析,每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。
諾禾致源宏轉錄組測序項目,不僅進行基因表達情況以及差異基因表達分析,還進行物種注釋及分類分析,多樣品間的比較分析等。此外,諾禾致源提供個性化分析的服務,可以根據客戶需求定制分析內容。
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物種注釋及分類 |
功能注釋(KEGG,eggNOG,CAZy) |
Nr數據庫比對 |
GO富集 |
KEGG富集 |
多樣品比較分析 |
宏轉錄組采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。
至2016年5月,諾禾致源已經成功對土壤、污水、淤泥、昆蟲腸道、口腔、糞便等多種生態環境中的微生物進行了宏轉錄組測序。
“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”,
確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。