環狀RNA(circular RNA, circRNA)是一類特殊的非編碼RNA分析,測序采用Illumina測序平臺進行測序,針對有參考基因組樣本開展準確的circRNA鑒定以及來源基因的分析,環狀RNA測序在醫學、農學研究領域應用越來越廣泛。
基于高通量測序,依據主流數據庫和circRNA鑒定軟件,分析項目物種的circRNA信息,深入挖掘circRNA在轉錄調控中所發揮的重要功能。
從材料選取,建庫測序,到數據分析,每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。
諾禾致源circRNA測序項目,通過高效富集circRNA,借助最主流軟件對circRNA進行鑒定,并通過分析來源基因,以深化對項目物種circRNA的功能研究。
了解更多>>分析內容 | 解決問題 |
參考序列比對 | 分析測序reads比對率和覆蓋度 |
circRNA鑒定 | 發現樣本中存在的circRNA |
circRNA來源基因分析 | 有助于明確哪些基因能夠形成circRNA |
circRNA表達水平定量 | circRNA在各個樣本中的表達水平 |
差異表達分析 | 樣本之間差異表達的circRNA |
GO、KEGG富集分析 | 明確來源基因的具體生物學功能 |
miRNA結合位點預測 | circRNA發揮海綿效應的基礎 |
環狀RNA測序采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。
至2015年12月,諾禾致源已經成功對人、鼠、羊、豬、雞、斑馬魚、果蠅、家蠶、蜜蜂、線蟲、擬南芥、油菜、水稻、棉花、稻瘟菌等30多個物種進行circRNA測序分析,做為一種相對較新的RNA測序產品,circRNA廣受關注,大量研究成果發表在權威期刊。“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”,確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。