,北京諾禾致源科技股份有限公司 ">
可針對樣本中的miRNA、siRNA、piRNA展開全面分析,既能鑒定已知sRNA、也能預(yù)測新的sRNA并預(yù)測sRNA的靶基因,為研究small RNA功能及調(diào)控機(jī)制提供有力手段。
|
||||||||||||||||||
[發(fā)表評論] [本類其他服務(wù)] [本類其他服務(wù)商] |
服務(wù)商: 北京諾禾致源科技股份有限公司 | 查看該公司所有服務(wù) >> |
Small RNA(sRNA)測序采用Illumina測序平臺,可針對樣本中的miRNA、siRNA、piRNA展開全面分析,既能鑒定已知sRNA、也能預(yù)測新的sRNA并預(yù)測sRNA的靶基因,為研究small RNA功能及調(diào)控機(jī)制提供有力手段。
Small RNA通過先進(jìn)的測序平臺,一次性可獲得數(shù)百萬條序列,結(jié)合先進(jìn)的分析方法,可在全基因組水平快速鑒定和預(yù)測各種類型的Small RNA,得到與調(diào)控相關(guān)的所有基因。
從材料選取,建庫測序,到數(shù)據(jù)分析,每一步都需要科學(xué)、縝密的設(shè)計,以保障高質(zhì)量研究成果。
諾禾致源small RNA測序項目,對已知和未知的small RNA進(jìn)行系統(tǒng)分類注釋,進(jìn)而通過堿基編輯分析、表達(dá)水平分析以及靶基因預(yù)測,全面挖掘small RNA的調(diào)控功能。
分析內(nèi)容 | 解決問題 |
參考序列比對 | 分析測序reads比對率和覆蓋度 |
small RNA分類注釋 | 篩選并鑒定鑒定已知的和新的sRNA |
堿基編輯分析 | miRNA種子序列分析 |
差異表達(dá)分析 | 樣本間差異表達(dá)的sRNA |
靶基因預(yù)測 | sRNA作用的靶基因信息 |
差異 sRNA 靶基因 GO、KEGG富集 |
深入挖掘sRNA功能 |
Small RNA測序采用先進(jìn)的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質(zhì)量的測序數(shù)據(jù)。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節(jié)點和Isilon存儲的高效組合,實現(xiàn)快速穩(wěn)定的測序數(shù)據(jù)分析及交付。隨著公司業(yè)務(wù)的發(fā)展,高性能計算平臺將會持續(xù)更新并擴(kuò)容,以保證高效的數(shù)據(jù)處理和安全的數(shù)據(jù)存儲。
至2015年12月,諾禾致源已經(jīng)成功對豬、牛、鼠、南極魚、鱘魚、紅旗東方魨、大鯢、揚(yáng)子鱷、梭子蟹、對蝦、扇貝、海參、瘧原蟲、蝗蟲等300多個物種進(jìn)行small RNA測序分析,并在The Plant Cell、Scientific Reports等權(quán)威期刊發(fā)表文章20多篇。“科學(xué)的方案設(shè)計,嚴(yán)格的質(zhì)控管理,專業(yè)的分析團(tuán)隊,豐富的項目經(jīng)驗,優(yōu)質(zhì)的項目服務(wù)”,確保每一個環(huán)節(jié)都能出色完成,助力科學(xué)研究。