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基于DROPLET細胞均分原理,可在極短時間內同時獲得數十萬個單細胞轉錄組信息,而且相較于其他平臺,成本大大降低。
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近年來,已有多種單細胞測序技術及平臺應運而生,10x Genomics基于DROPLET細胞均分原理,可在極短時間內同時獲得數十萬個單細胞轉錄組信息,而且相較于其他平臺,成本大大降低。
廣泛應用于血液病、腫瘤細胞異質性、鑒定罕見細胞類型、免疫細胞分型、疾病分型等領域;主要是針對大量細胞進行亞型分類,可結合傳統全長序列的擴增進行精確定量,精準揭秘疾病分子機制。
從材料選取,建庫測序,到數據分析,每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。
Cell Ranger™分析流程是針對10x Genomics® Chromium™ 3’單細胞轉錄組測序開發的完整分析流程,包括數據拆分、對細胞數目進行統計、基因表達定量、聚類及差異分析等。
1. 基本數據分析,細胞數目統計,單個細胞 reads 數目統計等; |
2. 質控分析,通過對 UMI 分析判定 PCR 擴增效率; |
3. 基因表達定量,獲得表達基因及其表達量數據; |
4. 聚類分析,選用 tSNE 進行聚類分析。 |
10x Genomics采用先進的Illumina測序平臺,快速、高效地讀取高質量的測序數據。
諾禾致源高性能計算平臺(High Performance Computing,HPC)采用DELL計算節點和Isilon存儲的高效組合,實現快速穩定的測序數據分析及交付。隨著公司業務的發展,高性能計算平臺將會持續更新并擴容,以保證高效的數據處理和安全的數據存儲。
至2015年12月,諾禾致源已經成功對豬、牛、鼠、南極魚、鱘魚、紅旗東方魨、大鯢、
揚子鱷、梭子蟹、對蝦、扇貝、海參、瘧原蟲、蝗蟲等300多個物種進行small RNA測序分析,
并在Plant Cell、Scientific reports等權威期刊發表文章20多篇。
“科學的方案設計,嚴格的質控管理,專業的分析團隊,豐富的項目經驗,優質的項目服務”,
確保每一個環節都能出色完成,助力科學研究。