基于CRISPR/Cas9技術,設計成千上萬個sgRNA,在全基因組范圍內進行基因編輯實驗,篩選出大量突變細胞,識別與特定表型相關的基因
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從建庫測序,到數據分析,每一步都需要科學、縝密的設計,以保障高質量研究成果。
脫靶檢測 | 分析內容 |
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CRISPR Screen (sgRNA libraries)檢測 |
基本分析 1.原始序列數據; 2.測序數據質量評估:去除低質量和接頭污染數據; 3.與參考序列進行比對、統計覆蓋度和測序深度。 |
高級信息分析 1.統計每一種 sgRNA 對應 reads 支持數 2.對每一組 sgRNA 進行 統計,比較出增加或者減少的reads數,并進行排序。 |