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高通量SNP檢測代做實驗
作為新一代的遺傳掃描工具,HRM技術(shù)是一種低成本、高通量、快速,且不受位點局限的檢測方法,是SNP篩查的最佳選擇。其具有"簡、效、快、廉"等其他技術(shù)難以比擬的優(yōu)勢。蘇州為真!
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 HRM技術(shù)服務(wù)之SNP檢測(snp檢測的最佳方案)

 

    單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs),指單個核苷酸堿基的改變,包括置換、顛換、缺失和插入,導(dǎo)致的核酸序列的多態(tài)性。在不同個體的同一條染色體或同一位點的核苷酸序列中,絕大多數(shù)核苷酸序列一致而只有一個堿基不同的現(xiàn)象,這就是SNP。SNP在人類基因組中數(shù)量較多,發(fā)生頻率較高,因此被認(rèn)為是繼微衛(wèi)星之后的新一代遺傳學(xué)標(biāo)記。

    HRM檢測SNP技術(shù)是依據(jù)在一定的溫度范圍內(nèi)將PCR擴(kuò)增的產(chǎn)物進(jìn)行變性,期間實時檢測體系內(nèi)熒光信號。熒光值隨著溫度變化,可繪制溶解曲線。每一段DNA都有其獨特的序列,因而也就有了獨特的熔解曲線形狀,如同DNA指紋圖譜一樣,具有很高的特異性、穩(wěn)定性和重復(fù)性。根據(jù)曲線準(zhǔn)確區(qū)分野生型純合子、雜合子和突變性純合子(下圖)。
   

 

 

    檢測SNP的方法有很多種。成本較低、通量較大的方法大都局限于已知、特定位點,如Taqman探針法。既要對已知位點分析又要查找未知位點,一般采用PCR+測序的方法,成本高、操作繁復(fù)較低。
作為新一代的遺傳掃描工具,HRM技術(shù)是一種低成本、高通量、快速,且不受位點局限的檢測方法,是SNP篩查的最佳選擇。其具有"簡、效、快、廉"等其他技術(shù)難以比擬的優(yōu)勢:
 簡:無需序列特異性探針,不受堿基位點局限,同時檢出已知或未知突變、SNP和甲基化位點:閉管操作,避免交叉污染。
 效:最低檢測0.1-0,01的突變或異常甲基化檢測SNP靈敏度和特異性均為100,。
 快:1次同時不多于384個樣本,在60-90分鐘內(nèi)完成檢測。
 廉:簡化操作步驟、降低人工和試劑成本,費用遠(yuǎn)少于測序、Taqman探針等方法。

    HRM技術(shù)特別適用于樣本量多、檢測位點較少的SNP、突變或甲基化分析,是不同于基因芯片檢測方法(檢測位點多,樣本少)的高通量方法。同時,也是基因芯片篩選后的多個基因在更多標(biāo)本中驗證的最佳方法。

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 客戶提供樣本DNA的分離、純化(可有為真公司代為提取)
 根據(jù)客戶提供相關(guān)信息進(jìn)行引物設(shè)計、方案設(shè)計
 處理DNA并運用HRM技術(shù)獲得特異溶解曲線
 結(jié)果分析,出具實驗報告,為臨床用藥提供依據(jù)

 

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