HRM技術服務之突變檢測
基因突變是指由于DNA堿基對的置換、增添或缺失而引起的基因結構的變化。基因突變在生物界中是普遍存在的,它是生物變異的主要原因,是生物進化的主要因素。但大多數基因突變對生物體是有害的,如果發生基因突變,就有可能破壞這種協調關系。絕大多數的人類遺傳病如人的色肓、糖尿病、白化病等遺傳病,都是突變性狀,是由基因突變造成的,這些病對人類健康構成了嚴重威脅。
目前突變研究手段比較
大致有三大類
一類是以熒光共振能量傳遞為基礎的檢測方法,簡單的說就是以定量PCR為基礎的,比如Taqman探針法、分子信標(Molecular beacon)和FRET(HybProbe),應用這一類方法時需要對突變位點背景很清楚,針對特定的突變位點設計并合成序列/位點特異性探針。
第二類是以分子雜交技術為基礎的檢測方法,如寡核苷酸連接分析(OLA)和動態等位基因特異性雜交(DASH),這幾種方法也均涉及到序列特異性探針。
第三類是基于PCR技術與其它方法相結合的檢測方法,如變性-高效液相色譜(DHPLC)、SSCP(單鏈構象多態性)、DGGE(變性梯度凝膠電泳)、測序、Pyrosequencing和Ecotilling、芯片等技術,這幾種方法在PCR擴增的基礎上對產物過柱分析,或電泳分析,無需合成序列特異性探針,不受位點的局限,可對已知和未知突變進行操作。但DHPLC儀器昂貴,使用成本高,SSCP和DGGE通量相對較小、操作繁瑣、成本高、速度慢;測序是所有突變檢測的金標準,但測序的成本相當可觀;Pyrosequencing技術的突出優勢在于Pooling,適用于大規模的等位基因頻率分析,但需要特殊的儀器,硬件成本高;Ecotilling是一種在目標區段內篩查SNP的高通量、低成本的方法,但由于需要合成特定的紅外引物,所以在樣本量少、研究區段多的情況下就無法體現其優勢。
為真公司創新使用基于羅氏LightCycler 480的基因突變-HRM檢測技術。其特點為:高通量、簡單、快速、省錢、高靈敏度;閉管檢測,避免污染造成的假陽性;靈敏度和精確度達到近100;HRM分析和PCR是在同時進行,減少了額外儀器,無疑成本更低,特異性和精確度更好。
作為新一代的遺傳掃描工具,HRM具有“簡、效、快、廉”等其它技術難以比擬的優勢:
簡:無需序列特異性探針,不受堿基位點局限,同時檢出已知或未知突變、SNP和甲基化位點;閉管操作,避免交叉污染。
效:最低檢測0.1-0.01的突變或異常甲基化,檢測SNP靈敏度和特異性均為100。
快:1次同時檢測不多于384個樣本,在60-90分鐘內完成檢測。
廉:簡化操作步驟、降低人工和試劑成本,費用遠少于測序、Taqman探針等方法。
HRM技術特別適用于樣本量多、檢測位點較少的SNP、突變或甲基化分析,是不同于基因芯片檢測方法(檢測位點多,樣本少)的高通量方法。同時,也是基因芯片篩選后的多個基因在更多標本中驗證的最佳方法。
突變-HRM檢測技術原理:
在一定的溫度范圍內將PCR擴增的產物進行變性,期間實時檢測體系內熒光信號。熒光值隨著溫度變化,可繪制溶解曲線。每一段DNA都有其獨特的序列,因而也就有了獨特的熔解曲線形狀,如同DNA指紋圖譜一樣,具有很高的特異性、穩定性和重復性。根據曲線準確區分野生型和突變型基因。
HRM高分辨率熔解曲線示意圖
不同的基因型表現為不同的HRM熔解曲線形狀
我們的服務:
免費的項目咨詢
客戶提供樣本DNA的分離、純化(可有為真公司代為提取)
根據客戶提供相關信息進行引物設計、方案設計
處理DNA并運用HRM技術獲得特異溶解曲線
結果分析,出具實驗報告,為臨床用藥提供依據
蘇州為真生物在基因突變分析和研究方面積累了豐富的經驗,擁有開展突變研究的先進儀器設備,具有自己獨到的研究策略和方法,能有效挖掘資源,能為你高效快速的進行突變位點檢測。
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